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* add biomek.py demo implementation * 更新LiquidHandlerBiomek类,添加资源创建功能,优化协议创建方法,修复部分代码格式问题,更新YAML配置以支持新功能。 * Test * fix biomek success type * Convert LH action to biomek. * Update biomek.py * 注册表上报handle和schema (param input) * 修复biomek缺少的字段 * delete 's' * Remove warnings * Update biomek.py * Biomek test * Update biomek.py * 新增transfer_biomek的msg * New transfer_biomek * Updated transfer_biomek * 更新transfer_biomek的msg * 更新transfer_biomek的msg * 支持Biomek创建 * new action * fix key name typo * New parameter for biomek to run. * Refine * Update * new actions * new actions * 1 * registry * fix biomek startup add action handles * fix handles not as default entry * biomek_test.py biomek_test.py是最新的版本,运行它会生成complete_biomek_protocol.json * Update biomek.py * biomek_test.py * fix liquid_handler.biomek handles * host node新增resource add时间统计 create_resource新增handle bump version to 0.9.2 * 修正物料上传时间 改用biomek_test 增加ResultInfoEncoder 支持返回结果上传 * 正确发送return_info结果 * 同步执行状态信息 * 取消raiseValueError提示 * Update biomek_test.py * 0608 DONE * 同步了Biomek.py 现在应可用 * biomek switch back to non-test * temp disable initialize resource * 37-biomek-i5i7 (#40) * add biomek.py demo implementation * 更新LiquidHandlerBiomek类,添加资源创建功能,优化协议创建方法,修复部分代码格式问题,更新YAML配置以支持新功能。 * Test * fix biomek success type * Convert LH action to biomek. * Update biomek.py * 注册表上报handle和schema (param input) * 修复biomek缺少的字段 * delete 's' * Remove warnings * Update biomek.py * Biomek test * Update biomek.py * 新增transfer_biomek的msg * New transfer_biomek * Updated transfer_biomek * 更新transfer_biomek的msg * 更新transfer_biomek的msg * 支持Biomek创建 * new action * fix key name typo * New parameter for biomek to run. * Refine * Update * new actions * new actions * 1 * registry * fix biomek startup add action handles * fix handles not as default entry * biomek_test.py biomek_test.py是最新的版本,运行它会生成complete_biomek_protocol.json * Update biomek.py * biomek_test.py * fix liquid_handler.biomek handles * host node新增resource add时间统计 create_resource新增handle bump version to 0.9.2 * 修正物料上传时间 改用biomek_test 增加ResultInfoEncoder 支持返回结果上传 * 正确发送return_info结果 * 同步执行状态信息 * 取消raiseValueError提示 * Update biomek_test.py * 0608 DONE * 同步了Biomek.py 现在应可用 * biomek switch back to non-test * temp disable initialize resource * Refine biomek * Refine copy issue * Refine --------- Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@pku.edu.cn> Co-authored-by: Guangxin Zhang <guangxin.zhang.bio@gmail.com> Co-authored-by: qxw138 <qxw@stu.pku.edu.cn> * Device visualization (#39) * Update README and MQTTClient for installation instructions and code improvements * feat: 支持local_config启动 add: 增加对crt path的说明,为传入config.py的相对路径 move: web component * add: registry description * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * feat: node_info_update srv fix: OTDeck cant create * close #12 feat: slave node registry * feat: show machine name fix: host node registry not uploaded * feat: add hplc registry * feat: add hplc registry * fix: hplc status typo * fix: devices/ * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * fix: device.class possible null * fix: HPLC additions with online service * fix: slave mode spin not working * fix: slave mode spin not working * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * feat: 多ProtocolNode 允许子设备ID相同 feat: 上报发现的ActionClient feat: Host重启动,通过discover机制要求slaveNode重新注册,实现信息及时上报 * feat: 支持env设置config * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * Device visualization (#14) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: missing hostname in devices_names fix: upload_file for model file * fix: missing paho-mqtt package bump version to 0.9.0 * fix startup add ResourceCreateFromOuter.action * fix type hint * update actions * update actions * host node add_resource_from_outer fix cmake list * pass device config to device class * add: bind_parent_ids to resource create action fix: message convert string * fix: host node should not be re_discovered * feat: resource tracker support dict * feat: add more necessary params * feat: fix boolean null in registry action data * feat: add outer resource * 编写mesh添加action * feat: append resource * add action * feat: vis 2d for plr * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate * Device visualization (#22) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * 编写mesh添加action * add action * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: multi channel * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * 提交 * fix: jobadd * fix: jobadd * fix: msg converter * tijiao * add resource creat easy action * identify debug msg * mq client id * 提取lh的joint发布 * unify liquid_handler definition * 修改物料跟随与物料添加逻辑 修改物料跟随与物料添加逻辑 将joint_publisher类移出lh的backends,但仍需要对lh的backends进行一些改写 * Revert "修改物料跟随与物料添加逻辑" This reverts commit498c997ad7. * Reapply "修改物料跟随与物料添加逻辑" This reverts commit3a60d2ae81. * Revert "Merge remote-tracking branch 'upstream/dev' into device_visualization" This reverts commitfa727220af, reversing changes made to498c997ad7. * 修改物料放下时的方法,如果选择 修改物料放下时的方法, 如果选择drop_trash,则删除物料显示 如果选择drop,则让其解除连接 * add biomek.py demo implementation * 更新LiquidHandlerBiomek类,添加资源创建功能,优化协议创建方法,修复部分代码格式问题,更新YAML配置以支持新功能。 * Test * fix biomek success type * Convert LH action to biomek. * Update biomek.py * 注册表上报handle和schema (param input) * 修复biomek缺少的字段 * delete 's' * Remove warnings * Update biomek.py * Biomek test * Update biomek.py * 新增transfer_biomek的msg * New transfer_biomek * Updated transfer_biomek * 更新transfer_biomek的msg * 更新transfer_biomek的msg * 支持Biomek创建 * new action * fix key name typo * New parameter for biomek to run. * Refine * Update * new actions * new actions * 1 * registry * fix biomek startup add action handles * fix handles not as default entry * unilab添加moveit启动 1,整合所有moveit节点到一个move_group中,并整合所有的controller依次激活 2,添加pymoveit2的节点,使用json可直接启动 3,修改机械臂规划方式,添加约束,让冗余关节不会进行过多移动 * biomek_test.py biomek_test.py是最新的版本,运行它会生成complete_biomek_protocol.json * Update biomek.py * biomek_test.py * fix liquid_handler.biomek handles * 修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题, * Revert "修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题," This reverts commit56d45b94f5. * Reapply "修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题," This reverts commit07d9db20c3. * 添加缺少物料:"plate_well_G12", * host node新增resource add时间统计 create_resource新增handle bump version to 0.9.2 * 修正物料上传时间 改用biomek_test 增加ResultInfoEncoder 支持返回结果上传 * 正确发送return_info结果 * 同步执行状态信息 * 取消raiseValueError提示 * Update biomek_test.py * 0608 DONE * 同步了Biomek.py 现在应可用 * biomek switch back to non-test * temp disable initialize resource * add * fix tip resource data * liquid states * change to debug level * Revert "change to debug level" This reverts commit5d9953c3e5. * Reapply "change to debug level" This reverts commit2487bb6ffc. * fix tip resource data * add full device * add moveit yaml * 修复moveit 增加post_init阶段,给予ros_node反向 * remove necessary node * fix moveit action client * remove necessary imports * Update moveit_interface.py * fix handler_key uppercase * json add liquids * fix setup * add * change to "sources" and "targets" for lh * bump version * remove parent's parent link --------- Co-authored-by: Harvey Que <Q-Query@outlook.com> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@pku.edu.cn> Co-authored-by: Guangxin Zhang <guangxin.zhang.bio@gmail.com> Co-authored-by: qxw138 <qxw@stu.pku.edu.cn> * Device visualization (#41) * Update README and MQTTClient for installation instructions and code improvements * feat: 支持local_config启动 add: 增加对crt path的说明,为传入config.py的相对路径 move: web component * add: registry description * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * feat: node_info_update srv fix: OTDeck cant create * close #12 feat: slave node registry * feat: show machine name fix: host node registry not uploaded * feat: add hplc registry * feat: add hplc registry * fix: hplc status typo * fix: devices/ * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * fix: device.class possible null * fix: HPLC additions with online service * fix: slave mode spin not working * fix: slave mode spin not working * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * feat: 多ProtocolNode 允许子设备ID相同 feat: 上报发现的ActionClient feat: Host重启动,通过discover机制要求slaveNode重新注册,实现信息及时上报 * feat: 支持env设置config * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * Device visualization (#14) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: missing hostname in devices_names fix: upload_file for model file * fix: missing paho-mqtt package bump version to 0.9.0 * fix startup add ResourceCreateFromOuter.action * fix type hint * update actions * update actions * host node add_resource_from_outer fix cmake list * pass device config to device class * add: bind_parent_ids to resource create action fix: message convert string * fix: host node should not be re_discovered * feat: resource tracker support dict * feat: add more necessary params * feat: fix boolean null in registry action data * feat: add outer resource * 编写mesh添加action * feat: append resource * add action * feat: vis 2d for plr * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate * Device visualization (#22) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * 编写mesh添加action * add action * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: multi channel * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * 提交 * fix: jobadd * fix: jobadd * fix: msg converter * tijiao * add resource creat easy action * identify debug msg * mq client id * 提取lh的joint发布 * unify liquid_handler definition * 修改物料跟随与物料添加逻辑 修改物料跟随与物料添加逻辑 将joint_publisher类移出lh的backends,但仍需要对lh的backends进行一些改写 * Revert "修改物料跟随与物料添加逻辑" This reverts commit498c997ad7. * Reapply "修改物料跟随与物料添加逻辑" This reverts commit3a60d2ae81. * Revert "Merge remote-tracking branch 'upstream/dev' into device_visualization" This reverts commitfa727220af, reversing changes made to498c997ad7. * 修改物料放下时的方法,如果选择 修改物料放下时的方法, 如果选择drop_trash,则删除物料显示 如果选择drop,则让其解除连接 * add biomek.py demo implementation * 更新LiquidHandlerBiomek类,添加资源创建功能,优化协议创建方法,修复部分代码格式问题,更新YAML配置以支持新功能。 * Test * fix biomek success type * Convert LH action to biomek. * Update biomek.py * 注册表上报handle和schema (param input) * 修复biomek缺少的字段 * delete 's' * Remove warnings * Update biomek.py * Biomek test * Update biomek.py * 新增transfer_biomek的msg * New transfer_biomek * Updated transfer_biomek * 更新transfer_biomek的msg * 更新transfer_biomek的msg * 支持Biomek创建 * new action * fix key name typo * New parameter for biomek to run. * Refine * Update * new actions * new actions * 1 * registry * fix biomek startup add action handles * fix handles not as default entry * unilab添加moveit启动 1,整合所有moveit节点到一个move_group中,并整合所有的controller依次激活 2,添加pymoveit2的节点,使用json可直接启动 3,修改机械臂规划方式,添加约束,让冗余关节不会进行过多移动 * biomek_test.py biomek_test.py是最新的版本,运行它会生成complete_biomek_protocol.json * Update biomek.py * biomek_test.py * fix liquid_handler.biomek handles * 修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题, * Revert "修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题," This reverts commit56d45b94f5. * Reapply "修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题," This reverts commit07d9db20c3. * 添加缺少物料:"plate_well_G12", * host node新增resource add时间统计 create_resource新增handle bump version to 0.9.2 * 修正物料上传时间 改用biomek_test 增加ResultInfoEncoder 支持返回结果上传 * 正确发送return_info结果 * 同步执行状态信息 * 取消raiseValueError提示 * Update biomek_test.py * 0608 DONE * 同步了Biomek.py 现在应可用 * biomek switch back to non-test * temp disable initialize resource * add * fix tip resource data * liquid states * change to debug level * Revert "change to debug level" This reverts commit5d9953c3e5. * Reapply "change to debug level" This reverts commit2487bb6ffc. * fix tip resource data * add full device * add moveit yaml * 修复moveit 增加post_init阶段,给予ros_node反向 * remove necessary node * fix moveit action client * remove necessary imports * Update moveit_interface.py * fix handler_key uppercase * json add liquids * fix setup * add * change to "sources" and "targets" for lh * bump version * remove parent's parent link * change arm's name * change name --------- Co-authored-by: Harvey Que <Q-Query@outlook.com> Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: q434343 <73513873+q434343@users.noreply.github.com> Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@pku.edu.cn> Co-authored-by: Guangxin Zhang <guangxin.zhang.bio@gmail.com> Co-authored-by: qxw138 <qxw@stu.pku.edu.cn> * fix move it * fix move it * create_resource * bump ver modify slot type * 增加modbus支持 调整protocol node以更好支持多种类型的read和write * 调整protocol node以更好支持多种类型的read和write * 补充日志 * Device visualization (#42) * Update README and MQTTClient for installation instructions and code improvements * feat: 支持local_config启动 add: 增加对crt path的说明,为传入config.py的相对路径 move: web component * add: registry description * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * feat: node_info_update srv fix: OTDeck cant create * close #12 feat: slave node registry * feat: show machine name fix: host node registry not uploaded * feat: add hplc registry * feat: add hplc registry * fix: hplc status typo * fix: devices/ * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * fix: device.class possible null * fix: HPLC additions with online service * fix: slave mode spin not working * fix: slave mode spin not working * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * feat: 多ProtocolNode 允许子设备ID相同 feat: 上报发现的ActionClient feat: Host重启动,通过discover机制要求slaveNode重新注册,实现信息及时上报 * feat: 支持env设置config * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * Device visualization (#14) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: missing hostname in devices_names fix: upload_file for model file * fix: missing paho-mqtt package bump version to 0.9.0 * fix startup add ResourceCreateFromOuter.action * fix type hint * update actions * update actions * host node add_resource_from_outer fix cmake list * pass device config to device class * add: bind_parent_ids to resource create action fix: message convert string * fix: host node should not be re_discovered * feat: resource tracker support dict * feat: add more necessary params * feat: fix boolean null in registry action data * feat: add outer resource * 编写mesh添加action * feat: append resource * add action * feat: vis 2d for plr * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate * Device visualization (#22) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * 编写mesh添加action * add action * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: multi channel * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * 提交 * fix: jobadd * fix: jobadd * fix: msg converter * tijiao * add resource creat easy action * identify debug msg * mq client id * 提取lh的joint发布 * unify liquid_handler definition * 修改物料跟随与物料添加逻辑 修改物料跟随与物料添加逻辑 将joint_publisher类移出lh的backends,但仍需要对lh的backends进行一些改写 * Revert "修改物料跟随与物料添加逻辑" This reverts commit498c997ad7. * Reapply "修改物料跟随与物料添加逻辑" This reverts commit3a60d2ae81. * Revert "Merge remote-tracking branch 'upstream/dev' into device_visualization" This reverts commitfa727220af, reversing changes made to498c997ad7. * 修改物料放下时的方法,如果选择 修改物料放下时的方法, 如果选择drop_trash,则删除物料显示 如果选择drop,则让其解除连接 * unilab添加moveit启动 1,整合所有moveit节点到一个move_group中,并整合所有的controller依次激活 2,添加pymoveit2的节点,使用json可直接启动 3,修改机械臂规划方式,添加约束,让冗余关节不会进行过多移动 * 修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题, * Revert "修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题," This reverts commit56d45b94f5. * Reapply "修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题," This reverts commit07d9db20c3. * 添加缺少物料:"plate_well_G12", * add * fix tip resource data * liquid states * change to debug level * Revert "change to debug level" This reverts commit5d9953c3e5. * Reapply "change to debug level" This reverts commit2487bb6ffc. * fix tip resource data * add full device * add moveit yaml * 修复moveit 增加post_init阶段,给予ros_node反向 * remove necessary node * fix moveit action client * remove necessary imports * Update moveit_interface.py * fix handler_key uppercase * json add liquids * fix setup * add * change to "sources" and "targets" for lh * bump version * remove parent's parent link * change arm's name * change name * fix ik error --------- Co-authored-by: Harvey Que <Q-Query@outlook.com> Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: q434343 <73513873+q434343@users.noreply.github.com> Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@pku.edu.cn> * Add Mock Device for Organic Synthesis\添加有机合成的虚拟仪器和Protocol (#43) * Add Device MockChiller Add device MockChiller * Add Device MockFilter * Add Device MockPump * Add Device MockRotavap * Add Device MockSeparator * Add Device MockStirrer * Add Device MockHeater * Add Device MockVacuum * Add Device MockSolenoidValve * Add Device Mock \_init_.py * 规范模拟设备代码与注册表信息 * 更改Mock大写文件夹名 * 删除大写目录 * Edited Mock device json * Match mock device with action * Edit mock device yaml * Add new action * Add Virtual Device, Action, YAML, Protocol for Organic Syn * 单独分类测试的protocol文件夹 * 更名Action --------- Co-authored-by: Xuwznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * bump version & protocol fix * hotfix: Add macos_sdk_config (#46) Co-authored-by: quehh <scienceol@outlook.com> * include device_mesh when pip install * 测试自动构建 * try build fix * try build * test artifacts * hotfix: Add .certs in .gitignore * create container * container 添加和更新完成 * Device registry port (#49) * Update README and MQTTClient for installation instructions and code improvements * feat: 支持local_config启动 add: 增加对crt path的说明,为传入config.py的相对路径 move: web component * add: registry description * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * feat: node_info_update srv fix: OTDeck cant create * close #12 feat: slave node registry * feat: show machine name fix: host node registry not uploaded * feat: add hplc registry * feat: add hplc registry * fix: hplc status typo * fix: devices/ * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * fix: device.class possible null * fix: HPLC additions with online service * fix: slave mode spin not working * fix: slave mode spin not working * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * feat: 多ProtocolNode 允许子设备ID相同 feat: 上报发现的ActionClient feat: Host重启动,通过discover机制要求slaveNode重新注册,实现信息及时上报 * feat: 支持env设置config * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * Device visualization (#14) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: missing hostname in devices_names fix: upload_file for model file * fix: missing paho-mqtt package bump version to 0.9.0 * fix startup add ResourceCreateFromOuter.action * fix type hint * update actions * update actions * host node add_resource_from_outer fix cmake list * pass device config to device class * add: bind_parent_ids to resource create action fix: message convert string * fix: host node should not be re_discovered * feat: resource tracker support dict * feat: add more necessary params * feat: fix boolean null in registry action data * feat: add outer resource * 编写mesh添加action * feat: append resource * add action * feat: vis 2d for plr * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate * Device visualization (#22) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * 编写mesh添加action * add action * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: multi channel * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * 提交 * fix: jobadd * fix: jobadd * fix: msg converter * tijiao * add resource creat easy action * identify debug msg * mq client id * unify liquid_handler definition * Update virtual_device.yaml * 更正了stir和heater的连接方式 * 区分了虚拟仪器中的八通阀和电磁阀,添加了两个阀门的驱动 * 修改了add protocol * 修复了阀门更新版的bug * 修复了添加protocol前缀导致的不能启动的bug * Fix handles * bump version to 0.9.6 * add resource edge upload * update container registry and handles * add virtual_separator virtual_rotavap fix transfer_pump * fix container value add parent_name to edge device id * 大图的问题都修复好了,添加了gassource和vacuum pump的驱动以及注册表 * default resource upload mode is false * 添加了icon的文件名在注册表里面 * 修改了json图中link的格式 * fix resource and edge upload * fix device ports * Fix edge id * 移除device的父节点关联 * separate registry sync and resource_add * 默认不进行注册表报送,通过命令unilabos-register或者增加启动参数 * 完善tip * protocol node不再嵌套显示 * bump version to 0.9.7 新增一个测试PumpTransferProtocol的teststation,亲测可以运行,将八通阀们和转移泵与pump_protocol适配 * protocol node 执行action不应携带自身device id * 添加了一套简易双八通阀工作站JSON,亲测能跑 * 修复了很多protocol,亲测能跑 * 添加了run column和filter through的protocol,亲测能跑 * fix mock_reactor * 修改了大图和小图的json,但是在前端上没看到改变 --------- Co-authored-by: Harvey Que <Q-Query@outlook.com> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: q434343 <73513873+q434343@users.noreply.github.com> Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@pku.edu.cn> * 更新workstation注册表 * 添加了两个protocol的检索功能 (#51) * 添加了两个protocol的检索liquid type功能 * fix workstation registry * 修复了没连接的几个仪器的link,添加了container的icon * 修改了json和注册表,现在大图全部的device都链接上了 * 修复了小图的json图,线全部连上了 * add work_station protocol handles (ports) * fix workstation action handle --------- Co-authored-by: Xuwznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@dp.tech> * 新增注册表补全功能,修复Protocol执行失败 * 支持通过导入方式补全注册表,新增工作流unilabos_device_id字段 * 修复不启用注册表补充就无法启动的bug * 修复部分识别error * 修复静态方法识别get status,注册表支持python类型 * status types对于嵌套类型返回的对象,暂时处理成字符串,无法直接进行转换 * 支持通过list[int],list[float]进行Int64MultiArray,Float64MultiArray的替换 * 成功动态导入的不再需要使用静态导入 * Fix handle names (#55) * fix handle names * improve evacuateAndRefill gas source finding * add camera and dependency (#56) * 修复auto-的Action在protocol node下错误注册 * 匹配init param schema格式 * Add channel_sources config in conda_build_config.yaml (#58) * 修复任务执行传参 * Create 5 new protocols & bump version 0.9.8 (#59) * 添加了5个缺失的protocol,验证了可以运行 * bump version to 0.9.8 * 修复新增的Action的字段缺失 --------- Co-authored-by: Xuwznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * 转换到ros消息时,要进行基础类型转换 * Update work_station.yaml (#60) * Update work_station.yaml * Checklist里面有XDL跟protocol之间没对齐的问题,工作量有点大找时间写完 * Create prcxi.py * Update prcxi.py * Update Prcxi * 更新中析仪器,以及启动示例 * 修改moveit_interface,并在mqtt上报时发送一个时间戳,方便网页端对数据的筛选 (#62) * Update README and MQTTClient for installation instructions and code improvements * feat: 支持local_config启动 add: 增加对crt path的说明,为传入config.py的相对路径 move: web component * add: registry description * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * feat: node_info_update srv fix: OTDeck cant create * close #12 feat: slave node registry * feat: show machine name fix: host node registry not uploaded * feat: add hplc registry * feat: add hplc registry * fix: hplc status typo * fix: devices/ * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * fix: device.class possible null * fix: HPLC additions with online service * fix: slave mode spin not working * fix: slave mode spin not working * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * feat: 多ProtocolNode 允许子设备ID相同 feat: 上报发现的ActionClient feat: Host重启动,通过discover机制要求slaveNode重新注册,实现信息及时上报 * feat: 支持env设置config * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * Device visualization (#14) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: missing hostname in devices_names fix: upload_file for model file * fix: missing paho-mqtt package bump version to 0.9.0 * fix startup add ResourceCreateFromOuter.action * fix type hint * update actions * update actions * host node add_resource_from_outer fix cmake list * pass device config to device class * add: bind_parent_ids to resource create action fix: message convert string * fix: host node should not be re_discovered * feat: resource tracker support dict * feat: add more necessary params * feat: fix boolean null in registry action data * feat: add outer resource * 编写mesh添加action * feat: append resource * add action * feat: vis 2d for plr * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate * Device visualization (#22) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * 编写mesh添加action * add action * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: multi channel * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * 提交 * fix: jobadd * fix: jobadd * fix: msg converter * tijiao * add resource creat easy action * identify debug msg * mq client id * 提取lh的joint发布 * unify liquid_handler definition * 修改物料跟随与物料添加逻辑 修改物料跟随与物料添加逻辑 将joint_publisher类移出lh的backends,但仍需要对lh的backends进行一些改写 * Revert "修改物料跟随与物料添加逻辑" This reverts commit498c997ad7. * Reapply "修改物料跟随与物料添加逻辑" This reverts commit3a60d2ae81. * Revert "Merge remote-tracking branch 'upstream/dev' into device_visualization" This reverts commitfa727220af, reversing changes made to498c997ad7. * 修改物料放下时的方法,如果选择 修改物料放下时的方法, 如果选择drop_trash,则删除物料显示 如果选择drop,则让其解除连接 * unilab添加moveit启动 1,整合所有moveit节点到一个move_group中,并整合所有的controller依次激活 2,添加pymoveit2的节点,使用json可直接启动 3,修改机械臂规划方式,添加约束,让冗余关节不会进行过多移动 * 修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题, * Revert "修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题," This reverts commit56d45b94f5. * Reapply "修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题," This reverts commit07d9db20c3. * 添加缺少物料:"plate_well_G12", * add * fix tip resource data * liquid states * change to debug level * Revert "change to debug level" This reverts commit5d9953c3e5. * Reapply "change to debug level" This reverts commit2487bb6ffc. * fix tip resource data * add full device * add moveit yaml * 修复moveit 增加post_init阶段,给予ros_node反向 * remove necessary node * fix moveit action client * remove necessary imports * Update moveit_interface.py * fix handler_key uppercase * json add liquids * fix setup * add * change to "sources" and "targets" for lh * bump version * remove parent's parent link * change arm's name * change name * fix ik error * 修改moveit_interface,并在mqtt上报时发送一个时间戳 --------- Co-authored-by: Harvey Que <Q-Query@outlook.com> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@pku.edu.cn> * 更新实例 * 更新实例 * 更新实例 * 修正prcxi启动 * 更新PRCXI配置,修改主机地址和设置状态,并添加示例用法 * add pickup tips for prcxi * 任意执行错误都应该返回failed * 任意执行错误都应该返回failed * Add plateT6 to PRCXI configuration and enhance error handling in liquid handling * prcxi blending * assert blending_times > 0 * update prcxi * update prcxi registry * Update prcxi.py to fit the function in unilabos. * 不生成已配置action的动作,增加prcxi的debug模式 * 增加注册表版本参数,支持将auto-指令人工检查后非auto,不生成人工已检查的指令,取消不必要的description生成 * 增加注册表版本参数,支持将auto-指令人工检查后非auto,不生成人工已检查的指令,取消不必要的description生成 * Update prcxi.py * 修复了部分的protocol因为XDL更新导致的问题 (#61) * 修复了部分的protocol因为XDL更新导致的问题 但是pumptransfer,add,dissolve,separate还没修,后续还需要写virtual固体加料器 * 补充了四个action * 添加了固体加样器,丰富了json,修改了add protocol * bump version to 0.9.9 * fix bugs from new actions * protocol完整修复版本& bump version to 0.9.10 * 修补了一些单位处理,bump version to 0.9.11 * 优化了全protocol的运行时间,除了pumptransfer相关的还没 * 补充了剩下的几个protocol --------- Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@dp.tech> Co-authored-by: Xuwznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * 修复action移除时的报错,更新注册表 * Update prcxi.py * Update prcxi.py * 新增simulator * Update prcxi.py * Update trash * Update prcxi.py * Update prcxi.py * Update for discard tips * Update prcxi.py * Update PRCXI * 更新axis等参数 * Update 9320 * get_well_container&get_tip_rack * update * Update 9320 * update * deck * 更新注册表&增加资源,parent应为resources字段 * Update 9320 * update * 新增set liquid方法 * 新增set liquid方法 * action to resource & 0.9.12 (#64) * action to resource & 0.9.12 * stir和adjustph的中的bug修不好 * modify prcxi * 0.9.12 update registry * update * update * registry upadte * Update * update * container_for_nothing * mix * registry fix * registry fix * registry fix * Update * Update prcxi.py * SET TIP RACK * bump version * update registry version & category * update set tip rack * yaml dump支持ordered dict,支持config_info * fix devices * fix resource check serialize * fix: Protocol node resource run (#65) * stir和adjustph的中的bug修不好 * fix sub-resource query in protocol node compiling * add resource placeholder to vessels * add the rest yaml * Update work_station.yaml --------- Co-authored-by: KCFeng425 <2100011801@stu.pku.edu.cn> * 采用http报送resource * 采用http报送resource * update * Update .gitignore * bump version to 0.10.0 * default param simulator * slim * Update * Update for prcxi * Update * Update * Refactor PRCXI9300Deck initialization and update plate configurations - Changed deck name from "PRCXI_Deck" to "PRCXI_Deck_9300". - Updated plate4 initialization to use get_well_container instead of get_tip_rack. - Modified plate4 material details with new UUID, code, and name. - Renamed output JSON file to "deck_9300_new.json". - Uncommented and adjusted liquid handling operations for clarity and future use. * test * update * Update prcxi_9300.json This one is good * update * fix protocol_node communication transfer * 修复注册表handles类型错误的问题 * 物料添加失败应该直接raise ValueError,不要等待 * 更正注册表中的数字类型 * Delete unnecessary files. * 新增lab_id直接传入 * fix vessel_id param passing in protocols * 新增dll预载,保证部分设备可正常使用unilabos_msgs * 修复可能的web template找不到的问题 新增联网获取json启动 删除非-g传入启动json的方式 兼容传参参数名短横线与下划线 * 修复可能的web template找不到的问题 新增联网获取json启动 删除非-g传入启动json的方式 兼容传参参数名短横线与下划线 更新版本到0.10.1 修复Upload Registry镜像不匹配 * 新增用户引导 * Device visualization (#67) * Update README and MQTTClient for installation instructions and code improvements * feat: 支持local_config启动 add: 增加对crt path的说明,为传入config.py的相对路径 move: web component * add: registry description * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * feat: node_info_update srv fix: OTDeck cant create * close #12 feat: slave node registry * feat: show machine name fix: host node registry not uploaded * feat: add hplc registry * feat: add hplc registry * fix: hplc status typo * fix: devices/ * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * fix: device.class possible null * fix: HPLC additions with online service * fix: slave mode spin not working * fix: slave mode spin not working * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * feat: 多ProtocolNode 允许子设备ID相同 feat: 上报发现的ActionClient feat: Host重启动,通过discover机制要求slaveNode重新注册,实现信息及时上报 * feat: 支持env设置config * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * Device visualization (#14) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: missing hostname in devices_names fix: upload_file for model file * fix: missing paho-mqtt package bump version to 0.9.0 * fix startup add ResourceCreateFromOuter.action * fix type hint * update actions * update actions * host node add_resource_from_outer fix cmake list * pass device config to device class * add: bind_parent_ids to resource create action fix: message convert string * fix: host node should not be re_discovered * feat: resource tracker support dict * feat: add more necessary params * feat: fix boolean null in registry action data * feat: add outer resource * 编写mesh添加action * feat: append resource * add action * feat: vis 2d for plr * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate * Device visualization (#22) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * 编写mesh添加action * add action * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: multi channel * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * 提交 * fix: jobadd * fix: jobadd * fix: msg converter * tijiao * add resource creat easy action * identify debug msg * mq client id * 提取lh的joint发布 * unify liquid_handler definition * 修改物料跟随与物料添加逻辑 修改物料跟随与物料添加逻辑 将joint_publisher类移出lh的backends,但仍需要对lh的backends进行一些改写 * Revert "修改物料跟随与物料添加逻辑" This reverts commit498c997ad7. * Reapply "修改物料跟随与物料添加逻辑" This reverts commit3a60d2ae81. * Revert "Merge remote-tracking branch 'upstream/dev' into device_visualization" This reverts commitfa727220af, reversing changes made to498c997ad7. * 修改物料放下时的方法,如果选择 修改物料放下时的方法, 如果选择drop_trash,则删除物料显示 如果选择drop,则让其解除连接 * unilab添加moveit启动 1,整合所有moveit节点到一个move_group中,并整合所有的controller依次激活 2,添加pymoveit2的节点,使用json可直接启动 3,修改机械臂规划方式,添加约束,让冗余关节不会进行过多移动 * 修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题, * Revert "修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题," This reverts commit56d45b94f5. * Reapply "修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题," This reverts commit07d9db20c3. * 添加缺少物料:"plate_well_G12", * add * fix tip resource data * liquid states * change to debug level * Revert "change to debug level" This reverts commit5d9953c3e5. * Reapply "change to debug level" This reverts commit2487bb6ffc. * fix tip resource data * add full device * add moveit yaml * 修复moveit 增加post_init阶段,给予ros_node反向 * remove necessary node * fix moveit action client * remove necessary imports * Update moveit_interface.py * fix handler_key uppercase * json add liquids * fix setup * add * change to "sources" and "targets" for lh * bump version * remove parent's parent link * change arm's name * change name * fix ik error * 修改moveit_interface,并在mqtt上报时发送一个时间戳 * 添加机械臂和移液站 * 添加 * 添加硬件 * update * 添加 --------- Co-authored-by: Harvey Que <Q-Query@outlook.com> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@pku.edu.cn> * 更新注册表 --------- Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@pku.edu.cn> Co-authored-by: Guangxin Zhang <guangxin.zhang.bio@gmail.com> Co-authored-by: qxw138 <qxw@stu.pku.edu.cn> Co-authored-by: q434343 <73513873+q434343@users.noreply.github.com> Co-authored-by: Harvey Que <Q-Query@outlook.com> Co-authored-by: Kongchang Feng <2100011801@stu.pku.edu.cn> Co-authored-by: hh. <103566763+Mile-Away@users.noreply.github.com> Co-authored-by: quehh <scienceol@outlook.com> Co-authored-by: Harvey Que <quehaohui@dp.tech> Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@dp.tech> Co-authored-by: ZiWei <131428629+ZiWei09@users.noreply.github.com>
387 lines
16 KiB
Python
387 lines
16 KiB
Python
import networkx as nx
|
||
import logging
|
||
import sys
|
||
from typing import List, Dict, Any, Optional
|
||
from .pump_protocol import generate_pump_protocol_with_rinsing
|
||
|
||
# 设置日志
|
||
logger = logging.getLogger(__name__)
|
||
|
||
# 确保输出编码为UTF-8
|
||
if hasattr(sys.stdout, 'reconfigure'):
|
||
try:
|
||
sys.stdout.reconfigure(encoding='utf-8')
|
||
sys.stderr.reconfigure(encoding='utf-8')
|
||
except:
|
||
pass
|
||
|
||
def debug_print(message):
|
||
"""调试输出函数 - 支持中文"""
|
||
try:
|
||
# 确保消息是字符串格式
|
||
safe_message = str(message)
|
||
print(f"[重置处理] {safe_message}", flush=True)
|
||
logger.info(f"[重置处理] {safe_message}")
|
||
except UnicodeEncodeError:
|
||
# 如果编码失败,尝试替换不支持的字符
|
||
safe_message = str(message).encode('utf-8', errors='replace').decode('utf-8')
|
||
print(f"[重置处理] {safe_message}", flush=True)
|
||
logger.info(f"[重置处理] {safe_message}")
|
||
except Exception as e:
|
||
# 最后的安全措施
|
||
fallback_message = f"日志输出错误: {repr(message)}"
|
||
print(f"[重置处理] {fallback_message}", flush=True)
|
||
logger.info(f"[重置处理] {fallback_message}")
|
||
|
||
def create_action_log(message: str, emoji: str = "📝") -> Dict[str, Any]:
|
||
"""创建一个动作日志 - 支持中文和emoji"""
|
||
try:
|
||
full_message = f"{emoji} {message}"
|
||
debug_print(full_message)
|
||
logger.info(full_message)
|
||
|
||
return {
|
||
"action_name": "wait",
|
||
"action_kwargs": {
|
||
"time": 0.1,
|
||
"log_message": full_message,
|
||
"progress_message": full_message
|
||
}
|
||
}
|
||
except Exception as e:
|
||
# 如果emoji有问题,使用纯文本
|
||
safe_message = f"[日志] {message}"
|
||
debug_print(safe_message)
|
||
logger.info(safe_message)
|
||
|
||
return {
|
||
"action_name": "wait",
|
||
"action_kwargs": {
|
||
"time": 0.1,
|
||
"log_message": safe_message,
|
||
"progress_message": safe_message
|
||
}
|
||
}
|
||
|
||
def find_solvent_vessel(G: nx.DiGraph, solvent: str) -> str:
|
||
"""
|
||
查找溶剂容器,支持多种匹配模式
|
||
|
||
Args:
|
||
G: 网络图
|
||
solvent: 溶剂名称(如 "methanol", "ethanol", "water")
|
||
|
||
Returns:
|
||
str: 溶剂容器ID
|
||
"""
|
||
debug_print(f"🔍 正在查找溶剂 '{solvent}' 的容器...")
|
||
|
||
# 构建可能的容器名称
|
||
possible_names = [
|
||
f"flask_{solvent}", # flask_methanol
|
||
f"bottle_{solvent}", # bottle_methanol
|
||
f"reagent_{solvent}", # reagent_methanol
|
||
f"reagent_bottle_{solvent}", # reagent_bottle_methanol
|
||
f"{solvent}_flask", # methanol_flask
|
||
f"{solvent}_bottle", # methanol_bottle
|
||
f"{solvent}", # methanol
|
||
f"vessel_{solvent}", # vessel_methanol
|
||
]
|
||
|
||
debug_print(f"🎯 候选容器名称: {possible_names[:3]}... (共{len(possible_names)}个)")
|
||
|
||
# 第一步:通过容器名称匹配
|
||
debug_print("📋 方法1: 精确名称匹配...")
|
||
for vessel_name in possible_names:
|
||
if vessel_name in G.nodes():
|
||
debug_print(f"✅ 通过名称匹配找到容器: {vessel_name}")
|
||
return vessel_name
|
||
debug_print("⚠️ 精确名称匹配失败,尝试模糊匹配...")
|
||
|
||
# 第二步:通过模糊匹配
|
||
debug_print("📋 方法2: 模糊名称匹配...")
|
||
for node_id in G.nodes():
|
||
if G.nodes[node_id].get('type') == 'container':
|
||
node_name = G.nodes[node_id].get('name', '').lower()
|
||
|
||
# 检查是否包含溶剂名称
|
||
if solvent.lower() in node_id.lower() or solvent.lower() in node_name:
|
||
debug_print(f"✅ 通过模糊匹配找到容器: {node_id}")
|
||
return node_id
|
||
debug_print("⚠️ 模糊匹配失败,尝试液体类型匹配...")
|
||
|
||
# 第三步:通过液体类型匹配
|
||
debug_print("📋 方法3: 液体类型匹配...")
|
||
for node_id in G.nodes():
|
||
if G.nodes[node_id].get('type') == 'container':
|
||
vessel_data = G.nodes[node_id].get('data', {})
|
||
liquids = vessel_data.get('liquid', [])
|
||
|
||
for liquid in liquids:
|
||
if isinstance(liquid, dict):
|
||
liquid_type = (liquid.get('liquid_type') or liquid.get('name', '')).lower()
|
||
reagent_name = vessel_data.get('reagent_name', '').lower()
|
||
|
||
if solvent.lower() in liquid_type or solvent.lower() in reagent_name:
|
||
debug_print(f"✅ 通过液体类型匹配找到容器: {node_id}")
|
||
return node_id
|
||
|
||
# 列出可用容器帮助调试
|
||
debug_print("📊 显示可用容器信息...")
|
||
available_containers = []
|
||
for node_id in G.nodes():
|
||
if G.nodes[node_id].get('type') == 'container':
|
||
vessel_data = G.nodes[node_id].get('data', {})
|
||
liquids = vessel_data.get('liquid', [])
|
||
liquid_types = [liquid.get('liquid_type', '') or liquid.get('name', '')
|
||
for liquid in liquids if isinstance(liquid, dict)]
|
||
|
||
available_containers.append({
|
||
'id': node_id,
|
||
'name': G.nodes[node_id].get('name', ''),
|
||
'liquids': liquid_types,
|
||
'reagent_name': vessel_data.get('reagent_name', '')
|
||
})
|
||
|
||
debug_print(f"📋 可用容器列表 (共{len(available_containers)}个):")
|
||
for i, container in enumerate(available_containers[:5]): # 只显示前5个
|
||
debug_print(f" {i+1}. 🥽 {container['id']}: {container['name']}")
|
||
debug_print(f" 💧 液体: {container['liquids']}")
|
||
debug_print(f" 🧪 试剂: {container['reagent_name']}")
|
||
|
||
if len(available_containers) > 5:
|
||
debug_print(f" ... 还有 {len(available_containers)-5} 个容器")
|
||
|
||
debug_print(f"❌ 找不到溶剂 '{solvent}' 对应的容器")
|
||
raise ValueError(f"找不到溶剂 '{solvent}' 对应的容器。尝试了: {possible_names[:3]}...")
|
||
|
||
def generate_reset_handling_protocol(
|
||
G: nx.DiGraph,
|
||
solvent: str,
|
||
vessel: Optional[str] = None, # 🆕 新增可选vessel参数
|
||
**kwargs # 接收其他可能的参数但不使用
|
||
) -> List[Dict[str, Any]]:
|
||
"""
|
||
生成重置处理协议序列 - 支持自定义容器
|
||
|
||
Args:
|
||
G: 有向图,节点为容器和设备
|
||
solvent: 溶剂名称(从XDL传入)
|
||
vessel: 目标容器名称(可选,默认为 "main_reactor")
|
||
**kwargs: 其他可选参数,但不使用
|
||
|
||
Returns:
|
||
List[Dict[str, Any]]: 动作序列
|
||
"""
|
||
action_sequence = []
|
||
|
||
# 🔧 修改:支持自定义vessel参数
|
||
target_vessel = vessel if vessel is not None else "main_reactor" # 默认目标容器
|
||
volume = 50.0 # 默认体积 50 mL
|
||
|
||
debug_print("=" * 60)
|
||
debug_print("🚀 开始生成重置处理协议")
|
||
debug_print(f"📋 输入参数:")
|
||
debug_print(f" 🧪 溶剂: {solvent}")
|
||
debug_print(f" 🥽 目标容器: {target_vessel} {'(默认)' if vessel is None else '(指定)'}")
|
||
debug_print(f" 💧 体积: {volume} mL")
|
||
debug_print(f" ⚙️ 其他参数: {kwargs}")
|
||
debug_print("=" * 60)
|
||
|
||
# 添加初始日志
|
||
action_sequence.append(create_action_log(f"开始重置处理操作 - 容器: {target_vessel}", "🎬"))
|
||
action_sequence.append(create_action_log(f"使用溶剂: {solvent}", "🧪"))
|
||
action_sequence.append(create_action_log(f"重置体积: {volume}mL", "💧"))
|
||
|
||
if vessel is None:
|
||
action_sequence.append(create_action_log("使用默认目标容器: main_reactor", "⚙️"))
|
||
else:
|
||
action_sequence.append(create_action_log(f"使用指定目标容器: {vessel}", "🎯"))
|
||
|
||
# 1. 验证目标容器存在
|
||
debug_print("🔍 步骤1: 验证目标容器...")
|
||
action_sequence.append(create_action_log("正在验证目标容器...", "🔍"))
|
||
|
||
if target_vessel not in G.nodes():
|
||
debug_print(f"❌ 目标容器 '{target_vessel}' 不存在于系统中!")
|
||
action_sequence.append(create_action_log(f"目标容器 '{target_vessel}' 不存在", "❌"))
|
||
raise ValueError(f"目标容器 '{target_vessel}' 不存在于系统中")
|
||
|
||
debug_print(f"✅ 目标容器 '{target_vessel}' 验证通过")
|
||
action_sequence.append(create_action_log(f"目标容器验证通过: {target_vessel}", "✅"))
|
||
|
||
# 2. 查找溶剂容器
|
||
debug_print("🔍 步骤2: 查找溶剂容器...")
|
||
action_sequence.append(create_action_log("正在查找溶剂容器...", "🔍"))
|
||
|
||
try:
|
||
solvent_vessel = find_solvent_vessel(G, solvent)
|
||
debug_print(f"✅ 找到溶剂容器: {solvent_vessel}")
|
||
action_sequence.append(create_action_log(f"找到溶剂容器: {solvent_vessel}", "✅"))
|
||
except ValueError as e:
|
||
debug_print(f"❌ 溶剂容器查找失败: {str(e)}")
|
||
action_sequence.append(create_action_log(f"溶剂容器查找失败: {str(e)}", "❌"))
|
||
raise ValueError(f"无法找到溶剂 '{solvent}': {str(e)}")
|
||
|
||
# 3. 验证路径存在
|
||
debug_print("🔍 步骤3: 验证传输路径...")
|
||
action_sequence.append(create_action_log("正在验证传输路径...", "🛤️"))
|
||
|
||
try:
|
||
path = nx.shortest_path(G, source=solvent_vessel, target=target_vessel)
|
||
debug_print(f"✅ 找到路径: {' → '.join(path)}")
|
||
action_sequence.append(create_action_log(f"传输路径: {' → '.join(path)}", "🛤️"))
|
||
except nx.NetworkXNoPath:
|
||
debug_print(f"❌ 路径不可达: {solvent_vessel} → {target_vessel}")
|
||
action_sequence.append(create_action_log(f"路径不可达: {solvent_vessel} → {target_vessel}", "❌"))
|
||
raise ValueError(f"从溶剂容器 '{solvent_vessel}' 到目标容器 '{target_vessel}' 没有可用路径")
|
||
|
||
# 4. 使用pump_protocol转移溶剂
|
||
debug_print("🔍 步骤4: 转移溶剂...")
|
||
action_sequence.append(create_action_log("开始溶剂转移操作...", "🚰"))
|
||
|
||
debug_print(f"🚛 开始转移: {solvent_vessel} → {target_vessel}")
|
||
debug_print(f"💧 转移体积: {volume} mL")
|
||
action_sequence.append(create_action_log(f"转移: {solvent_vessel} → {target_vessel} ({volume}mL)", "🚛"))
|
||
|
||
try:
|
||
debug_print("🔄 生成泵送协议...")
|
||
action_sequence.append(create_action_log("正在生成泵送协议...", "🔄"))
|
||
|
||
pump_actions = generate_pump_protocol_with_rinsing(
|
||
G=G,
|
||
from_vessel=solvent_vessel,
|
||
to_vessel=target_vessel,
|
||
volume=volume,
|
||
amount="",
|
||
time=0.0,
|
||
viscous=False,
|
||
rinsing_solvent="", # 重置处理不需要清洗
|
||
rinsing_volume=0.0,
|
||
rinsing_repeats=0,
|
||
solid=False,
|
||
flowrate=2.5, # 正常流速
|
||
transfer_flowrate=0.5 # 正常转移流速
|
||
)
|
||
|
||
action_sequence.extend(pump_actions)
|
||
debug_print(f"✅ 泵送协议已添加: {len(pump_actions)} 个动作")
|
||
action_sequence.append(create_action_log(f"泵送协议完成 ({len(pump_actions)} 个操作)", "✅"))
|
||
|
||
except Exception as e:
|
||
debug_print(f"❌ 泵送协议生成失败: {str(e)}")
|
||
action_sequence.append(create_action_log(f"泵送协议生成失败: {str(e)}", "❌"))
|
||
raise ValueError(f"生成泵协议时出错: {str(e)}")
|
||
|
||
# 5. 等待溶剂稳定
|
||
debug_print("🔍 步骤5: 等待溶剂稳定...")
|
||
action_sequence.append(create_action_log("等待溶剂稳定...", "⏳"))
|
||
|
||
# 模拟运行时间优化
|
||
debug_print("⏱️ 检查模拟运行时间限制...")
|
||
original_wait_time = 10.0 # 原始等待时间
|
||
simulation_time_limit = 5.0 # 模拟运行时间限制:5秒
|
||
|
||
final_wait_time = min(original_wait_time, simulation_time_limit)
|
||
|
||
if original_wait_time > simulation_time_limit:
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debug_print(f"🎮 模拟运行优化: {original_wait_time}s → {final_wait_time}s")
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action_sequence.append(create_action_log(f"时间优化: {original_wait_time}s → {final_wait_time}s", "⚡"))
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else:
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debug_print(f"✅ 时间在限制内: {final_wait_time}s 保持不变")
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action_sequence.append(create_action_log(f"等待时间: {final_wait_time}s", "⏰"))
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action_sequence.append({
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"action_name": "wait",
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"action_kwargs": {
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"time": final_wait_time,
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"description": f"等待溶剂 {solvent} 在容器 {target_vessel} 中稳定" + (f" (模拟时间)" if original_wait_time != final_wait_time else "")
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}
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})
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debug_print(f"✅ 稳定等待已添加: {final_wait_time}s")
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# 显示时间调整信息
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if original_wait_time != final_wait_time:
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debug_print(f"🎭 模拟优化说明: 原计划 {original_wait_time}s,实际模拟 {final_wait_time}s")
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action_sequence.append(create_action_log("应用模拟时间优化", "🎭"))
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# 总结
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debug_print("=" * 60)
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debug_print(f"🎉 重置处理协议生成完成!")
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debug_print(f"📊 总结信息:")
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debug_print(f" 📋 总动作数: {len(action_sequence)} 个")
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debug_print(f" 🧪 溶剂: {solvent}")
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debug_print(f" 🥽 源容器: {solvent_vessel}")
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debug_print(f" 🥽 目标容器: {target_vessel} {'(默认)' if vessel is None else '(指定)'}")
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debug_print(f" 💧 转移体积: {volume} mL")
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debug_print(f" ⏱️ 预计总时间: {(final_wait_time + 5):.0f} 秒")
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debug_print(f" 🎯 操作结果: 已添加 {volume} mL {solvent} 到 {target_vessel}")
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debug_print("=" * 60)
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# 添加完成日志
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summary_msg = f"重置处理完成: {target_vessel} (使用 {volume}mL {solvent})"
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if vessel is None:
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summary_msg += " [默认容器]"
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else:
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summary_msg += " [指定容器]"
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action_sequence.append(create_action_log(summary_msg, "🎉"))
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return action_sequence
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# === 便捷函数 ===
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def reset_main_reactor(G: nx.DiGraph, solvent: str = "methanol", **kwargs) -> List[Dict[str, Any]]:
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"""重置主反应器 (默认行为)"""
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debug_print(f"🔄 重置主反应器,使用溶剂: {solvent}")
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||
return generate_reset_handling_protocol(G, solvent=solvent, vessel=None, **kwargs)
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def reset_custom_vessel(G: nx.DiGraph, vessel: str, solvent: str = "methanol", **kwargs) -> List[Dict[str, Any]]:
|
||
"""重置指定容器"""
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||
debug_print(f"🔄 重置指定容器: {vessel},使用溶剂: {solvent}")
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||
return generate_reset_handling_protocol(G, solvent=solvent, vessel=vessel, **kwargs)
|
||
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||
def reset_with_water(G: nx.DiGraph, vessel: Optional[str] = None, **kwargs) -> List[Dict[str, Any]]:
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||
"""使用水重置容器"""
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||
target = vessel or "main_reactor"
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||
debug_print(f"💧 使用水重置容器: {target}")
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||
return generate_reset_handling_protocol(G, solvent="water", vessel=vessel, **kwargs)
|
||
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||
def reset_with_methanol(G: nx.DiGraph, vessel: Optional[str] = None, **kwargs) -> List[Dict[str, Any]]:
|
||
"""使用甲醇重置容器"""
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||
target = vessel or "main_reactor"
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||
debug_print(f"🧪 使用甲醇重置容器: {target}")
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||
return generate_reset_handling_protocol(G, solvent="methanol", vessel=vessel, **kwargs)
|
||
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||
def reset_with_ethanol(G: nx.DiGraph, vessel: Optional[str] = None, **kwargs) -> List[Dict[str, Any]]:
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"""使用乙醇重置容器"""
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||
target = vessel or "main_reactor"
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||
debug_print(f"🧪 使用乙醇重置容器: {target}")
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return generate_reset_handling_protocol(G, solvent="ethanol", vessel=vessel, **kwargs)
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# 测试函数
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def test_reset_handling_protocol():
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"""测试重置处理协议"""
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debug_print("=== 重置处理协议增强中文版测试 ===")
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# 测试溶剂名称
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debug_print("🧪 测试常用溶剂名称...")
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test_solvents = ["methanol", "ethanol", "water", "acetone", "dmso"]
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for solvent in test_solvents:
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debug_print(f" 🔍 测试溶剂: {solvent}")
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# 测试容器参数
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debug_print("🥽 测试容器参数...")
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test_cases = [
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{"solvent": "methanol", "vessel": None, "desc": "默认容器"},
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{"solvent": "ethanol", "vessel": "reactor_2", "desc": "指定容器"},
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{"solvent": "water", "vessel": "flask_1", "desc": "自定义容器"}
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]
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for case in test_cases:
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debug_print(f" 🧪 测试案例: {case['desc']} - {case['solvent']} -> {case['vessel'] or 'main_reactor'}")
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debug_print("✅ 测试完成")
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if __name__ == "__main__":
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||
test_reset_handling_protocol() |