mirror of
https://github.com/dptech-corp/Uni-Lab-OS.git
synced 2025-12-17 21:11:12 +00:00
* add biomek.py demo implementation * 更新LiquidHandlerBiomek类,添加资源创建功能,优化协议创建方法,修复部分代码格式问题,更新YAML配置以支持新功能。 * Test * fix biomek success type * Convert LH action to biomek. * Update biomek.py * 注册表上报handle和schema (param input) * 修复biomek缺少的字段 * delete 's' * Remove warnings * Update biomek.py * Biomek test * Update biomek.py * 新增transfer_biomek的msg * New transfer_biomek * Updated transfer_biomek * 更新transfer_biomek的msg * 更新transfer_biomek的msg * 支持Biomek创建 * new action * fix key name typo * New parameter for biomek to run. * Refine * Update * new actions * new actions * 1 * registry * fix biomek startup add action handles * fix handles not as default entry * biomek_test.py biomek_test.py是最新的版本,运行它会生成complete_biomek_protocol.json * Update biomek.py * biomek_test.py * fix liquid_handler.biomek handles * host node新增resource add时间统计 create_resource新增handle bump version to 0.9.2 * 修正物料上传时间 改用biomek_test 增加ResultInfoEncoder 支持返回结果上传 * 正确发送return_info结果 * 同步执行状态信息 * 取消raiseValueError提示 * Update biomek_test.py * 0608 DONE * 同步了Biomek.py 现在应可用 * biomek switch back to non-test * temp disable initialize resource * 37-biomek-i5i7 (#40) * add biomek.py demo implementation * 更新LiquidHandlerBiomek类,添加资源创建功能,优化协议创建方法,修复部分代码格式问题,更新YAML配置以支持新功能。 * Test * fix biomek success type * Convert LH action to biomek. * Update biomek.py * 注册表上报handle和schema (param input) * 修复biomek缺少的字段 * delete 's' * Remove warnings * Update biomek.py * Biomek test * Update biomek.py * 新增transfer_biomek的msg * New transfer_biomek * Updated transfer_biomek * 更新transfer_biomek的msg * 更新transfer_biomek的msg * 支持Biomek创建 * new action * fix key name typo * New parameter for biomek to run. * Refine * Update * new actions * new actions * 1 * registry * fix biomek startup add action handles * fix handles not as default entry * biomek_test.py biomek_test.py是最新的版本,运行它会生成complete_biomek_protocol.json * Update biomek.py * biomek_test.py * fix liquid_handler.biomek handles * host node新增resource add时间统计 create_resource新增handle bump version to 0.9.2 * 修正物料上传时间 改用biomek_test 增加ResultInfoEncoder 支持返回结果上传 * 正确发送return_info结果 * 同步执行状态信息 * 取消raiseValueError提示 * Update biomek_test.py * 0608 DONE * 同步了Biomek.py 现在应可用 * biomek switch back to non-test * temp disable initialize resource * Refine biomek * Refine copy issue * Refine --------- Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@pku.edu.cn> Co-authored-by: Guangxin Zhang <guangxin.zhang.bio@gmail.com> Co-authored-by: qxw138 <qxw@stu.pku.edu.cn> * Device visualization (#39) * Update README and MQTTClient for installation instructions and code improvements * feat: 支持local_config启动 add: 增加对crt path的说明,为传入config.py的相对路径 move: web component * add: registry description * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * feat: node_info_update srv fix: OTDeck cant create * close #12 feat: slave node registry * feat: show machine name fix: host node registry not uploaded * feat: add hplc registry * feat: add hplc registry * fix: hplc status typo * fix: devices/ * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * fix: device.class possible null * fix: HPLC additions with online service * fix: slave mode spin not working * fix: slave mode spin not working * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * feat: 多ProtocolNode 允许子设备ID相同 feat: 上报发现的ActionClient feat: Host重启动,通过discover机制要求slaveNode重新注册,实现信息及时上报 * feat: 支持env设置config * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * Device visualization (#14) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: missing hostname in devices_names fix: upload_file for model file * fix: missing paho-mqtt package bump version to 0.9.0 * fix startup add ResourceCreateFromOuter.action * fix type hint * update actions * update actions * host node add_resource_from_outer fix cmake list * pass device config to device class * add: bind_parent_ids to resource create action fix: message convert string * fix: host node should not be re_discovered * feat: resource tracker support dict * feat: add more necessary params * feat: fix boolean null in registry action data * feat: add outer resource * 编写mesh添加action * feat: append resource * add action * feat: vis 2d for plr * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate * Device visualization (#22) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * 编写mesh添加action * add action * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: multi channel * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * 提交 * fix: jobadd * fix: jobadd * fix: msg converter * tijiao * add resource creat easy action * identify debug msg * mq client id * 提取lh的joint发布 * unify liquid_handler definition * 修改物料跟随与物料添加逻辑 修改物料跟随与物料添加逻辑 将joint_publisher类移出lh的backends,但仍需要对lh的backends进行一些改写 * Revert "修改物料跟随与物料添加逻辑" This reverts commit498c997ad7. * Reapply "修改物料跟随与物料添加逻辑" This reverts commit3a60d2ae81. * Revert "Merge remote-tracking branch 'upstream/dev' into device_visualization" This reverts commitfa727220af, reversing changes made to498c997ad7. * 修改物料放下时的方法,如果选择 修改物料放下时的方法, 如果选择drop_trash,则删除物料显示 如果选择drop,则让其解除连接 * add biomek.py demo implementation * 更新LiquidHandlerBiomek类,添加资源创建功能,优化协议创建方法,修复部分代码格式问题,更新YAML配置以支持新功能。 * Test * fix biomek success type * Convert LH action to biomek. * Update biomek.py * 注册表上报handle和schema (param input) * 修复biomek缺少的字段 * delete 's' * Remove warnings * Update biomek.py * Biomek test * Update biomek.py * 新增transfer_biomek的msg * New transfer_biomek * Updated transfer_biomek * 更新transfer_biomek的msg * 更新transfer_biomek的msg * 支持Biomek创建 * new action * fix key name typo * New parameter for biomek to run. * Refine * Update * new actions * new actions * 1 * registry * fix biomek startup add action handles * fix handles not as default entry * unilab添加moveit启动 1,整合所有moveit节点到一个move_group中,并整合所有的controller依次激活 2,添加pymoveit2的节点,使用json可直接启动 3,修改机械臂规划方式,添加约束,让冗余关节不会进行过多移动 * biomek_test.py biomek_test.py是最新的版本,运行它会生成complete_biomek_protocol.json * Update biomek.py * biomek_test.py * fix liquid_handler.biomek handles * 修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题, * Revert "修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题," This reverts commit56d45b94f5. * Reapply "修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题," This reverts commit07d9db20c3. * 添加缺少物料:"plate_well_G12", * host node新增resource add时间统计 create_resource新增handle bump version to 0.9.2 * 修正物料上传时间 改用biomek_test 增加ResultInfoEncoder 支持返回结果上传 * 正确发送return_info结果 * 同步执行状态信息 * 取消raiseValueError提示 * Update biomek_test.py * 0608 DONE * 同步了Biomek.py 现在应可用 * biomek switch back to non-test * temp disable initialize resource * add * fix tip resource data * liquid states * change to debug level * Revert "change to debug level" This reverts commit5d9953c3e5. * Reapply "change to debug level" This reverts commit2487bb6ffc. * fix tip resource data * add full device * add moveit yaml * 修复moveit 增加post_init阶段,给予ros_node反向 * remove necessary node * fix moveit action client * remove necessary imports * Update moveit_interface.py * fix handler_key uppercase * json add liquids * fix setup * add * change to "sources" and "targets" for lh * bump version * remove parent's parent link --------- Co-authored-by: Harvey Que <Q-Query@outlook.com> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@pku.edu.cn> Co-authored-by: Guangxin Zhang <guangxin.zhang.bio@gmail.com> Co-authored-by: qxw138 <qxw@stu.pku.edu.cn> * Device visualization (#41) * Update README and MQTTClient for installation instructions and code improvements * feat: 支持local_config启动 add: 增加对crt path的说明,为传入config.py的相对路径 move: web component * add: registry description * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * feat: node_info_update srv fix: OTDeck cant create * close #12 feat: slave node registry * feat: show machine name fix: host node registry not uploaded * feat: add hplc registry * feat: add hplc registry * fix: hplc status typo * fix: devices/ * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * fix: device.class possible null * fix: HPLC additions with online service * fix: slave mode spin not working * fix: slave mode spin not working * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * feat: 多ProtocolNode 允许子设备ID相同 feat: 上报发现的ActionClient feat: Host重启动,通过discover机制要求slaveNode重新注册,实现信息及时上报 * feat: 支持env设置config * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * Device visualization (#14) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: missing hostname in devices_names fix: upload_file for model file * fix: missing paho-mqtt package bump version to 0.9.0 * fix startup add ResourceCreateFromOuter.action * fix type hint * update actions * update actions * host node add_resource_from_outer fix cmake list * pass device config to device class * add: bind_parent_ids to resource create action fix: message convert string * fix: host node should not be re_discovered * feat: resource tracker support dict * feat: add more necessary params * feat: fix boolean null in registry action data * feat: add outer resource * 编写mesh添加action * feat: append resource * add action * feat: vis 2d for plr * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate * Device visualization (#22) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * 编写mesh添加action * add action * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: multi channel * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * 提交 * fix: jobadd * fix: jobadd * fix: msg converter * tijiao * add resource creat easy action * identify debug msg * mq client id * 提取lh的joint发布 * unify liquid_handler definition * 修改物料跟随与物料添加逻辑 修改物料跟随与物料添加逻辑 将joint_publisher类移出lh的backends,但仍需要对lh的backends进行一些改写 * Revert "修改物料跟随与物料添加逻辑" This reverts commit498c997ad7. * Reapply "修改物料跟随与物料添加逻辑" This reverts commit3a60d2ae81. * Revert "Merge remote-tracking branch 'upstream/dev' into device_visualization" This reverts commitfa727220af, reversing changes made to498c997ad7. * 修改物料放下时的方法,如果选择 修改物料放下时的方法, 如果选择drop_trash,则删除物料显示 如果选择drop,则让其解除连接 * add biomek.py demo implementation * 更新LiquidHandlerBiomek类,添加资源创建功能,优化协议创建方法,修复部分代码格式问题,更新YAML配置以支持新功能。 * Test * fix biomek success type * Convert LH action to biomek. * Update biomek.py * 注册表上报handle和schema (param input) * 修复biomek缺少的字段 * delete 's' * Remove warnings * Update biomek.py * Biomek test * Update biomek.py * 新增transfer_biomek的msg * New transfer_biomek * Updated transfer_biomek * 更新transfer_biomek的msg * 更新transfer_biomek的msg * 支持Biomek创建 * new action * fix key name typo * New parameter for biomek to run. * Refine * Update * new actions * new actions * 1 * registry * fix biomek startup add action handles * fix handles not as default entry * unilab添加moveit启动 1,整合所有moveit节点到一个move_group中,并整合所有的controller依次激活 2,添加pymoveit2的节点,使用json可直接启动 3,修改机械臂规划方式,添加约束,让冗余关节不会进行过多移动 * biomek_test.py biomek_test.py是最新的版本,运行它会生成complete_biomek_protocol.json * Update biomek.py * biomek_test.py * fix liquid_handler.biomek handles * 修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题, * Revert "修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题," This reverts commit56d45b94f5. * Reapply "修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题," This reverts commit07d9db20c3. * 添加缺少物料:"plate_well_G12", * host node新增resource add时间统计 create_resource新增handle bump version to 0.9.2 * 修正物料上传时间 改用biomek_test 增加ResultInfoEncoder 支持返回结果上传 * 正确发送return_info结果 * 同步执行状态信息 * 取消raiseValueError提示 * Update biomek_test.py * 0608 DONE * 同步了Biomek.py 现在应可用 * biomek switch back to non-test * temp disable initialize resource * add * fix tip resource data * liquid states * change to debug level * Revert "change to debug level" This reverts commit5d9953c3e5. * Reapply "change to debug level" This reverts commit2487bb6ffc. * fix tip resource data * add full device * add moveit yaml * 修复moveit 增加post_init阶段,给予ros_node反向 * remove necessary node * fix moveit action client * remove necessary imports * Update moveit_interface.py * fix handler_key uppercase * json add liquids * fix setup * add * change to "sources" and "targets" for lh * bump version * remove parent's parent link * change arm's name * change name --------- Co-authored-by: Harvey Que <Q-Query@outlook.com> Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: q434343 <73513873+q434343@users.noreply.github.com> Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@pku.edu.cn> Co-authored-by: Guangxin Zhang <guangxin.zhang.bio@gmail.com> Co-authored-by: qxw138 <qxw@stu.pku.edu.cn> * fix move it * fix move it * create_resource * bump ver modify slot type * 增加modbus支持 调整protocol node以更好支持多种类型的read和write * 调整protocol node以更好支持多种类型的read和write * 补充日志 * Device visualization (#42) * Update README and MQTTClient for installation instructions and code improvements * feat: 支持local_config启动 add: 增加对crt path的说明,为传入config.py的相对路径 move: web component * add: registry description * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * feat: node_info_update srv fix: OTDeck cant create * close #12 feat: slave node registry * feat: show machine name fix: host node registry not uploaded * feat: add hplc registry * feat: add hplc registry * fix: hplc status typo * fix: devices/ * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * fix: device.class possible null * fix: HPLC additions with online service * fix: slave mode spin not working * fix: slave mode spin not working * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * feat: 多ProtocolNode 允许子设备ID相同 feat: 上报发现的ActionClient feat: Host重启动,通过discover机制要求slaveNode重新注册,实现信息及时上报 * feat: 支持env设置config * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * Device visualization (#14) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: missing hostname in devices_names fix: upload_file for model file * fix: missing paho-mqtt package bump version to 0.9.0 * fix startup add ResourceCreateFromOuter.action * fix type hint * update actions * update actions * host node add_resource_from_outer fix cmake list * pass device config to device class * add: bind_parent_ids to resource create action fix: message convert string * fix: host node should not be re_discovered * feat: resource tracker support dict * feat: add more necessary params * feat: fix boolean null in registry action data * feat: add outer resource * 编写mesh添加action * feat: append resource * add action * feat: vis 2d for plr * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate * Device visualization (#22) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * 编写mesh添加action * add action * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: multi channel * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * 提交 * fix: jobadd * fix: jobadd * fix: msg converter * tijiao * add resource creat easy action * identify debug msg * mq client id * 提取lh的joint发布 * unify liquid_handler definition * 修改物料跟随与物料添加逻辑 修改物料跟随与物料添加逻辑 将joint_publisher类移出lh的backends,但仍需要对lh的backends进行一些改写 * Revert "修改物料跟随与物料添加逻辑" This reverts commit498c997ad7. * Reapply "修改物料跟随与物料添加逻辑" This reverts commit3a60d2ae81. * Revert "Merge remote-tracking branch 'upstream/dev' into device_visualization" This reverts commitfa727220af, reversing changes made to498c997ad7. * 修改物料放下时的方法,如果选择 修改物料放下时的方法, 如果选择drop_trash,则删除物料显示 如果选择drop,则让其解除连接 * unilab添加moveit启动 1,整合所有moveit节点到一个move_group中,并整合所有的controller依次激活 2,添加pymoveit2的节点,使用json可直接启动 3,修改机械臂规划方式,添加约束,让冗余关节不会进行过多移动 * 修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题, * Revert "修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题," This reverts commit56d45b94f5. * Reapply "修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题," This reverts commit07d9db20c3. * 添加缺少物料:"plate_well_G12", * add * fix tip resource data * liquid states * change to debug level * Revert "change to debug level" This reverts commit5d9953c3e5. * Reapply "change to debug level" This reverts commit2487bb6ffc. * fix tip resource data * add full device * add moveit yaml * 修复moveit 增加post_init阶段,给予ros_node反向 * remove necessary node * fix moveit action client * remove necessary imports * Update moveit_interface.py * fix handler_key uppercase * json add liquids * fix setup * add * change to "sources" and "targets" for lh * bump version * remove parent's parent link * change arm's name * change name * fix ik error --------- Co-authored-by: Harvey Que <Q-Query@outlook.com> Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: q434343 <73513873+q434343@users.noreply.github.com> Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@pku.edu.cn> * Add Mock Device for Organic Synthesis\添加有机合成的虚拟仪器和Protocol (#43) * Add Device MockChiller Add device MockChiller * Add Device MockFilter * Add Device MockPump * Add Device MockRotavap * Add Device MockSeparator * Add Device MockStirrer * Add Device MockHeater * Add Device MockVacuum * Add Device MockSolenoidValve * Add Device Mock \_init_.py * 规范模拟设备代码与注册表信息 * 更改Mock大写文件夹名 * 删除大写目录 * Edited Mock device json * Match mock device with action * Edit mock device yaml * Add new action * Add Virtual Device, Action, YAML, Protocol for Organic Syn * 单独分类测试的protocol文件夹 * 更名Action --------- Co-authored-by: Xuwznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * bump version & protocol fix * hotfix: Add macos_sdk_config (#46) Co-authored-by: quehh <scienceol@outlook.com> * include device_mesh when pip install * 测试自动构建 * try build fix * try build * test artifacts * hotfix: Add .certs in .gitignore * create container * container 添加和更新完成 * Device registry port (#49) * Update README and MQTTClient for installation instructions and code improvements * feat: 支持local_config启动 add: 增加对crt path的说明,为传入config.py的相对路径 move: web component * add: registry description * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * feat: node_info_update srv fix: OTDeck cant create * close #12 feat: slave node registry * feat: show machine name fix: host node registry not uploaded * feat: add hplc registry * feat: add hplc registry * fix: hplc status typo * fix: devices/ * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * fix: device.class possible null * fix: HPLC additions with online service * fix: slave mode spin not working * fix: slave mode spin not working * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * feat: 多ProtocolNode 允许子设备ID相同 feat: 上报发现的ActionClient feat: Host重启动,通过discover机制要求slaveNode重新注册,实现信息及时上报 * feat: 支持env设置config * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * Device visualization (#14) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: missing hostname in devices_names fix: upload_file for model file * fix: missing paho-mqtt package bump version to 0.9.0 * fix startup add ResourceCreateFromOuter.action * fix type hint * update actions * update actions * host node add_resource_from_outer fix cmake list * pass device config to device class * add: bind_parent_ids to resource create action fix: message convert string * fix: host node should not be re_discovered * feat: resource tracker support dict * feat: add more necessary params * feat: fix boolean null in registry action data * feat: add outer resource * 编写mesh添加action * feat: append resource * add action * feat: vis 2d for plr * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate * Device visualization (#22) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * 编写mesh添加action * add action * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: multi channel * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * 提交 * fix: jobadd * fix: jobadd * fix: msg converter * tijiao * add resource creat easy action * identify debug msg * mq client id * unify liquid_handler definition * Update virtual_device.yaml * 更正了stir和heater的连接方式 * 区分了虚拟仪器中的八通阀和电磁阀,添加了两个阀门的驱动 * 修改了add protocol * 修复了阀门更新版的bug * 修复了添加protocol前缀导致的不能启动的bug * Fix handles * bump version to 0.9.6 * add resource edge upload * update container registry and handles * add virtual_separator virtual_rotavap fix transfer_pump * fix container value add parent_name to edge device id * 大图的问题都修复好了,添加了gassource和vacuum pump的驱动以及注册表 * default resource upload mode is false * 添加了icon的文件名在注册表里面 * 修改了json图中link的格式 * fix resource and edge upload * fix device ports * Fix edge id * 移除device的父节点关联 * separate registry sync and resource_add * 默认不进行注册表报送,通过命令unilabos-register或者增加启动参数 * 完善tip * protocol node不再嵌套显示 * bump version to 0.9.7 新增一个测试PumpTransferProtocol的teststation,亲测可以运行,将八通阀们和转移泵与pump_protocol适配 * protocol node 执行action不应携带自身device id * 添加了一套简易双八通阀工作站JSON,亲测能跑 * 修复了很多protocol,亲测能跑 * 添加了run column和filter through的protocol,亲测能跑 * fix mock_reactor * 修改了大图和小图的json,但是在前端上没看到改变 --------- Co-authored-by: Harvey Que <Q-Query@outlook.com> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: q434343 <73513873+q434343@users.noreply.github.com> Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@pku.edu.cn> * 更新workstation注册表 * 添加了两个protocol的检索功能 (#51) * 添加了两个protocol的检索liquid type功能 * fix workstation registry * 修复了没连接的几个仪器的link,添加了container的icon * 修改了json和注册表,现在大图全部的device都链接上了 * 修复了小图的json图,线全部连上了 * add work_station protocol handles (ports) * fix workstation action handle --------- Co-authored-by: Xuwznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@dp.tech> * 新增注册表补全功能,修复Protocol执行失败 * 支持通过导入方式补全注册表,新增工作流unilabos_device_id字段 * 修复不启用注册表补充就无法启动的bug * 修复部分识别error * 修复静态方法识别get status,注册表支持python类型 * status types对于嵌套类型返回的对象,暂时处理成字符串,无法直接进行转换 * 支持通过list[int],list[float]进行Int64MultiArray,Float64MultiArray的替换 * 成功动态导入的不再需要使用静态导入 * Fix handle names (#55) * fix handle names * improve evacuateAndRefill gas source finding * add camera and dependency (#56) * 修复auto-的Action在protocol node下错误注册 * 匹配init param schema格式 * Add channel_sources config in conda_build_config.yaml (#58) * 修复任务执行传参 * Create 5 new protocols & bump version 0.9.8 (#59) * 添加了5个缺失的protocol,验证了可以运行 * bump version to 0.9.8 * 修复新增的Action的字段缺失 --------- Co-authored-by: Xuwznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * 转换到ros消息时,要进行基础类型转换 * Update work_station.yaml (#60) * Update work_station.yaml * Checklist里面有XDL跟protocol之间没对齐的问题,工作量有点大找时间写完 * Create prcxi.py * Update prcxi.py * Update Prcxi * 更新中析仪器,以及启动示例 * 修改moveit_interface,并在mqtt上报时发送一个时间戳,方便网页端对数据的筛选 (#62) * Update README and MQTTClient for installation instructions and code improvements * feat: 支持local_config启动 add: 增加对crt path的说明,为传入config.py的相对路径 move: web component * add: registry description * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * feat: node_info_update srv fix: OTDeck cant create * close #12 feat: slave node registry * feat: show machine name fix: host node registry not uploaded * feat: add hplc registry * feat: add hplc registry * fix: hplc status typo * fix: devices/ * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * fix: device.class possible null * fix: HPLC additions with online service * fix: slave mode spin not working * fix: slave mode spin not working * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * feat: 多ProtocolNode 允许子设备ID相同 feat: 上报发现的ActionClient feat: Host重启动,通过discover机制要求slaveNode重新注册,实现信息及时上报 * feat: 支持env设置config * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * Device visualization (#14) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: missing hostname in devices_names fix: upload_file for model file * fix: missing paho-mqtt package bump version to 0.9.0 * fix startup add ResourceCreateFromOuter.action * fix type hint * update actions * update actions * host node add_resource_from_outer fix cmake list * pass device config to device class * add: bind_parent_ids to resource create action fix: message convert string * fix: host node should not be re_discovered * feat: resource tracker support dict * feat: add more necessary params * feat: fix boolean null in registry action data * feat: add outer resource * 编写mesh添加action * feat: append resource * add action * feat: vis 2d for plr * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate * Device visualization (#22) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * 编写mesh添加action * add action * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: multi channel * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * 提交 * fix: jobadd * fix: jobadd * fix: msg converter * tijiao * add resource creat easy action * identify debug msg * mq client id * 提取lh的joint发布 * unify liquid_handler definition * 修改物料跟随与物料添加逻辑 修改物料跟随与物料添加逻辑 将joint_publisher类移出lh的backends,但仍需要对lh的backends进行一些改写 * Revert "修改物料跟随与物料添加逻辑" This reverts commit498c997ad7. * Reapply "修改物料跟随与物料添加逻辑" This reverts commit3a60d2ae81. * Revert "Merge remote-tracking branch 'upstream/dev' into device_visualization" This reverts commitfa727220af, reversing changes made to498c997ad7. * 修改物料放下时的方法,如果选择 修改物料放下时的方法, 如果选择drop_trash,则删除物料显示 如果选择drop,则让其解除连接 * unilab添加moveit启动 1,整合所有moveit节点到一个move_group中,并整合所有的controller依次激活 2,添加pymoveit2的节点,使用json可直接启动 3,修改机械臂规划方式,添加约束,让冗余关节不会进行过多移动 * 修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题, * Revert "修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题," This reverts commit56d45b94f5. * Reapply "修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题," This reverts commit07d9db20c3. * 添加缺少物料:"plate_well_G12", * add * fix tip resource data * liquid states * change to debug level * Revert "change to debug level" This reverts commit5d9953c3e5. * Reapply "change to debug level" This reverts commit2487bb6ffc. * fix tip resource data * add full device * add moveit yaml * 修复moveit 增加post_init阶段,给予ros_node反向 * remove necessary node * fix moveit action client * remove necessary imports * Update moveit_interface.py * fix handler_key uppercase * json add liquids * fix setup * add * change to "sources" and "targets" for lh * bump version * remove parent's parent link * change arm's name * change name * fix ik error * 修改moveit_interface,并在mqtt上报时发送一个时间戳 --------- Co-authored-by: Harvey Que <Q-Query@outlook.com> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@pku.edu.cn> * 更新实例 * 更新实例 * 更新实例 * 修正prcxi启动 * 更新PRCXI配置,修改主机地址和设置状态,并添加示例用法 * add pickup tips for prcxi * 任意执行错误都应该返回failed * 任意执行错误都应该返回failed * Add plateT6 to PRCXI configuration and enhance error handling in liquid handling * prcxi blending * assert blending_times > 0 * update prcxi * update prcxi registry * Update prcxi.py to fit the function in unilabos. * 不生成已配置action的动作,增加prcxi的debug模式 * 增加注册表版本参数,支持将auto-指令人工检查后非auto,不生成人工已检查的指令,取消不必要的description生成 * 增加注册表版本参数,支持将auto-指令人工检查后非auto,不生成人工已检查的指令,取消不必要的description生成 * Update prcxi.py * 修复了部分的protocol因为XDL更新导致的问题 (#61) * 修复了部分的protocol因为XDL更新导致的问题 但是pumptransfer,add,dissolve,separate还没修,后续还需要写virtual固体加料器 * 补充了四个action * 添加了固体加样器,丰富了json,修改了add protocol * bump version to 0.9.9 * fix bugs from new actions * protocol完整修复版本& bump version to 0.9.10 * 修补了一些单位处理,bump version to 0.9.11 * 优化了全protocol的运行时间,除了pumptransfer相关的还没 * 补充了剩下的几个protocol --------- Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@dp.tech> Co-authored-by: Xuwznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * 修复action移除时的报错,更新注册表 * Update prcxi.py * Update prcxi.py * 新增simulator * Update prcxi.py * Update trash * Update prcxi.py * Update prcxi.py * Update for discard tips * Update prcxi.py * Update PRCXI * 更新axis等参数 * Update 9320 * get_well_container&get_tip_rack * update * Update 9320 * update * deck * 更新注册表&增加资源,parent应为resources字段 * Update 9320 * update * 新增set liquid方法 * 新增set liquid方法 * action to resource & 0.9.12 (#64) * action to resource & 0.9.12 * stir和adjustph的中的bug修不好 * modify prcxi * 0.9.12 update registry * update * update * registry upadte * Update * update * container_for_nothing * mix * registry fix * registry fix * registry fix * Update * Update prcxi.py * SET TIP RACK * bump version * update registry version & category * update set tip rack * yaml dump支持ordered dict,支持config_info * fix devices * fix resource check serialize * fix: Protocol node resource run (#65) * stir和adjustph的中的bug修不好 * fix sub-resource query in protocol node compiling * add resource placeholder to vessels * add the rest yaml * Update work_station.yaml --------- Co-authored-by: KCFeng425 <2100011801@stu.pku.edu.cn> * 采用http报送resource * 采用http报送resource * update * Update .gitignore * bump version to 0.10.0 * default param simulator * slim * Update * Update for prcxi * Update * Update * Refactor PRCXI9300Deck initialization and update plate configurations - Changed deck name from "PRCXI_Deck" to "PRCXI_Deck_9300". - Updated plate4 initialization to use get_well_container instead of get_tip_rack. - Modified plate4 material details with new UUID, code, and name. - Renamed output JSON file to "deck_9300_new.json". - Uncommented and adjusted liquid handling operations for clarity and future use. * test * update * Update prcxi_9300.json This one is good * update * fix protocol_node communication transfer * 修复注册表handles类型错误的问题 * 物料添加失败应该直接raise ValueError,不要等待 * 更正注册表中的数字类型 * Delete unnecessary files. * 新增lab_id直接传入 * fix vessel_id param passing in protocols * 新增dll预载,保证部分设备可正常使用unilabos_msgs * 修复可能的web template找不到的问题 新增联网获取json启动 删除非-g传入启动json的方式 兼容传参参数名短横线与下划线 * 修复可能的web template找不到的问题 新增联网获取json启动 删除非-g传入启动json的方式 兼容传参参数名短横线与下划线 更新版本到0.10.1 修复Upload Registry镜像不匹配 * 新增用户引导 * Device visualization (#67) * Update README and MQTTClient for installation instructions and code improvements * feat: 支持local_config启动 add: 增加对crt path的说明,为传入config.py的相对路径 move: web component * add: registry description * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * feat: node_info_update srv fix: OTDeck cant create * close #12 feat: slave node registry * feat: show machine name fix: host node registry not uploaded * feat: add hplc registry * feat: add hplc registry * fix: hplc status typo * fix: devices/ * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * fix: device.class possible null * fix: HPLC additions with online service * fix: slave mode spin not working * fix: slave mode spin not working * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * feat: 多ProtocolNode 允许子设备ID相同 feat: 上报发现的ActionClient feat: Host重启动,通过discover机制要求slaveNode重新注册,实现信息及时上报 * feat: 支持env设置config * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * Device visualization (#14) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: missing hostname in devices_names fix: upload_file for model file * fix: missing paho-mqtt package bump version to 0.9.0 * fix startup add ResourceCreateFromOuter.action * fix type hint * update actions * update actions * host node add_resource_from_outer fix cmake list * pass device config to device class * add: bind_parent_ids to resource create action fix: message convert string * fix: host node should not be re_discovered * feat: resource tracker support dict * feat: add more necessary params * feat: fix boolean null in registry action data * feat: add outer resource * 编写mesh添加action * feat: append resource * add action * feat: vis 2d for plr * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate * Device visualization (#22) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * 编写mesh添加action * add action * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: multi channel * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * 提交 * fix: jobadd * fix: jobadd * fix: msg converter * tijiao * add resource creat easy action * identify debug msg * mq client id * 提取lh的joint发布 * unify liquid_handler definition * 修改物料跟随与物料添加逻辑 修改物料跟随与物料添加逻辑 将joint_publisher类移出lh的backends,但仍需要对lh的backends进行一些改写 * Revert "修改物料跟随与物料添加逻辑" This reverts commit498c997ad7. * Reapply "修改物料跟随与物料添加逻辑" This reverts commit3a60d2ae81. * Revert "Merge remote-tracking branch 'upstream/dev' into device_visualization" This reverts commitfa727220af, reversing changes made to498c997ad7. * 修改物料放下时的方法,如果选择 修改物料放下时的方法, 如果选择drop_trash,则删除物料显示 如果选择drop,则让其解除连接 * unilab添加moveit启动 1,整合所有moveit节点到一个move_group中,并整合所有的controller依次激活 2,添加pymoveit2的节点,使用json可直接启动 3,修改机械臂规划方式,添加约束,让冗余关节不会进行过多移动 * 修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题, * Revert "修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题," This reverts commit56d45b94f5. * Reapply "修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题," This reverts commit07d9db20c3. * 添加缺少物料:"plate_well_G12", * add * fix tip resource data * liquid states * change to debug level * Revert "change to debug level" This reverts commit5d9953c3e5. * Reapply "change to debug level" This reverts commit2487bb6ffc. * fix tip resource data * add full device * add moveit yaml * 修复moveit 增加post_init阶段,给予ros_node反向 * remove necessary node * fix moveit action client * remove necessary imports * Update moveit_interface.py * fix handler_key uppercase * json add liquids * fix setup * add * change to "sources" and "targets" for lh * bump version * remove parent's parent link * change arm's name * change name * fix ik error * 修改moveit_interface,并在mqtt上报时发送一个时间戳 * 添加机械臂和移液站 * 添加 * 添加硬件 * update * 添加 --------- Co-authored-by: Harvey Que <Q-Query@outlook.com> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@pku.edu.cn> * 更新注册表 --------- Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@pku.edu.cn> Co-authored-by: Guangxin Zhang <guangxin.zhang.bio@gmail.com> Co-authored-by: qxw138 <qxw@stu.pku.edu.cn> Co-authored-by: q434343 <73513873+q434343@users.noreply.github.com> Co-authored-by: Harvey Que <Q-Query@outlook.com> Co-authored-by: Kongchang Feng <2100011801@stu.pku.edu.cn> Co-authored-by: hh. <103566763+Mile-Away@users.noreply.github.com> Co-authored-by: quehh <scienceol@outlook.com> Co-authored-by: Harvey Que <quehaohui@dp.tech> Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@dp.tech> Co-authored-by: ZiWei <131428629+ZiWei09@users.noreply.github.com>
480 lines
20 KiB
Python
480 lines
20 KiB
Python
from typing import List, Dict, Any, Optional, Union
|
||
import networkx as nx
|
||
import logging
|
||
import re
|
||
|
||
logger = logging.getLogger(__name__)
|
||
|
||
def debug_print(message):
|
||
"""调试输出"""
|
||
print(f"🧪 [EVAPORATE] {message}", flush=True)
|
||
logger.info(f"[EVAPORATE] {message}")
|
||
|
||
def parse_time_input(time_input: Union[str, float]) -> float:
|
||
"""
|
||
解析时间输入,支持带单位的字符串
|
||
|
||
Args:
|
||
time_input: 时间输入(如 "3 min", "180", "0.5 h" 等)
|
||
|
||
Returns:
|
||
float: 时间(秒)
|
||
"""
|
||
if isinstance(time_input, (int, float)):
|
||
debug_print(f"⏱️ 时间输入为数字: {time_input}s ✨")
|
||
return float(time_input) # 🔧 确保返回float
|
||
|
||
if not time_input or not str(time_input).strip():
|
||
debug_print(f"⚠️ 时间输入为空,使用默认值: 180s (3分钟) 🕐")
|
||
return 180.0 # 默认3分钟
|
||
|
||
time_str = str(time_input).lower().strip()
|
||
debug_print(f"🔍 解析时间输入: '{time_str}' 📝")
|
||
|
||
# 处理未知时间
|
||
if time_str in ['?', 'unknown', 'tbd']:
|
||
default_time = 180.0 # 默认3分钟
|
||
debug_print(f"❓ 检测到未知时间,使用默认值: {default_time}s (3分钟) 🤷♀️")
|
||
return default_time
|
||
|
||
# 移除空格并提取数字和单位
|
||
time_clean = re.sub(r'\s+', '', time_str)
|
||
|
||
# 匹配数字和单位的正则表达式
|
||
match = re.match(r'([0-9]*\.?[0-9]+)\s*(s|sec|second|min|minute|h|hr|hour|d|day)?', time_clean)
|
||
|
||
if not match:
|
||
# 如果无法解析,尝试直接转换为数字(默认秒)
|
||
try:
|
||
value = float(time_str)
|
||
debug_print(f"✅ 时间解析成功: {time_str} → {value}s(无单位,默认秒)⏰")
|
||
return float(value) # 🔧 确保返回float
|
||
except ValueError:
|
||
debug_print(f"❌ 无法解析时间: '{time_str}',使用默认值180s (3分钟) 😅")
|
||
return 180.0
|
||
|
||
value = float(match.group(1))
|
||
unit = match.group(2) or 's' # 默认单位为秒
|
||
|
||
# 转换为秒
|
||
if unit in ['min', 'minute']:
|
||
time_sec = value * 60.0 # min -> s
|
||
debug_print(f"🕐 时间转换: {value} 分钟 → {time_sec}s ⏰")
|
||
elif unit in ['h', 'hr', 'hour']:
|
||
time_sec = value * 3600.0 # h -> s
|
||
debug_print(f"🕐 时间转换: {value} 小时 → {time_sec}s ({time_sec/60:.1f}分钟) ⏰")
|
||
elif unit in ['d', 'day']:
|
||
time_sec = value * 86400.0 # d -> s
|
||
debug_print(f"🕐 时间转换: {value} 天 → {time_sec}s ({time_sec/3600:.1f}小时) ⏰")
|
||
else: # s, sec, second 或默认
|
||
time_sec = value # 已经是s
|
||
debug_print(f"🕐 时间转换: {value}s → {time_sec}s (已是秒) ⏰")
|
||
|
||
return float(time_sec) # 🔧 确保返回float
|
||
|
||
def find_rotavap_device(G: nx.DiGraph, vessel: str = None) -> Optional[str]:
|
||
"""
|
||
在组态图中查找旋转蒸发仪设备
|
||
|
||
Args:
|
||
G: 设备图
|
||
vessel: 指定的设备名称(可选)
|
||
|
||
Returns:
|
||
str: 找到的旋转蒸发仪设备ID,如果没找到返回None
|
||
"""
|
||
debug_print("🔍 开始查找旋转蒸发仪设备... 🌪️")
|
||
|
||
# 如果指定了vessel,先检查是否存在且是旋转蒸发仪
|
||
if vessel:
|
||
debug_print(f"🎯 检查指定设备: {vessel} 🔧")
|
||
if vessel in G.nodes():
|
||
node_data = G.nodes[vessel]
|
||
node_class = node_data.get('class', '')
|
||
node_type = node_data.get('type', '')
|
||
|
||
debug_print(f"📋 设备信息 {vessel}: class={node_class}, type={node_type}")
|
||
|
||
# 检查是否为旋转蒸发仪
|
||
if any(keyword in str(node_class).lower() for keyword in ['rotavap', 'rotary', 'evaporat']):
|
||
debug_print(f"🎉 找到指定的旋转蒸发仪: {vessel} ✨")
|
||
return vessel
|
||
elif node_type == 'device':
|
||
debug_print(f"✅ 指定设备存在,尝试直接使用: {vessel} 🔧")
|
||
return vessel
|
||
else:
|
||
debug_print(f"❌ 指定的设备 {vessel} 不存在 😞")
|
||
|
||
# 在所有设备中查找旋转蒸发仪
|
||
debug_print("🔎 在所有设备中搜索旋转蒸发仪... 🕵️♀️")
|
||
rotavap_candidates = []
|
||
|
||
for node_id, node_data in G.nodes(data=True):
|
||
node_class = node_data.get('class', '')
|
||
node_type = node_data.get('type', '')
|
||
|
||
# 跳过非设备节点
|
||
if node_type != 'device':
|
||
continue
|
||
|
||
# 检查设备类型
|
||
if any(keyword in str(node_class).lower() for keyword in ['rotavap', 'rotary', 'evaporat']):
|
||
rotavap_candidates.append(node_id)
|
||
debug_print(f"🌟 找到旋转蒸发仪候选: {node_id} (class: {node_class}) 🌪️")
|
||
elif any(keyword in str(node_id).lower() for keyword in ['rotavap', 'rotary', 'evaporat']):
|
||
rotavap_candidates.append(node_id)
|
||
debug_print(f"🌟 找到旋转蒸发仪候选 (按名称): {node_id} 🌪️")
|
||
|
||
if rotavap_candidates:
|
||
selected = rotavap_candidates[0] # 选择第一个找到的
|
||
debug_print(f"🎯 选择旋转蒸发仪: {selected} 🏆")
|
||
return selected
|
||
|
||
debug_print("😭 未找到旋转蒸发仪设备 💔")
|
||
return None
|
||
|
||
def find_connected_vessel(G: nx.DiGraph, rotavap_device: str) -> Optional[str]:
|
||
"""
|
||
查找与旋转蒸发仪连接的容器
|
||
|
||
Args:
|
||
G: 设备图
|
||
rotavap_device: 旋转蒸发仪设备ID
|
||
|
||
Returns:
|
||
str: 连接的容器ID,如果没找到返回None
|
||
"""
|
||
debug_print(f"🔗 查找与 {rotavap_device} 连接的容器... 🥽")
|
||
|
||
# 查看旋转蒸发仪的子设备
|
||
rotavap_data = G.nodes[rotavap_device]
|
||
children = rotavap_data.get('children', [])
|
||
|
||
debug_print(f"👶 检查子设备: {children}")
|
||
for child_id in children:
|
||
if child_id in G.nodes():
|
||
child_data = G.nodes[child_id]
|
||
child_type = child_data.get('type', '')
|
||
|
||
if child_type == 'container':
|
||
debug_print(f"🎉 找到连接的容器: {child_id} 🥽✨")
|
||
return child_id
|
||
|
||
# 查看邻接的容器
|
||
debug_print("🤝 检查邻接设备...")
|
||
for neighbor in G.neighbors(rotavap_device):
|
||
neighbor_data = G.nodes[neighbor]
|
||
neighbor_type = neighbor_data.get('type', '')
|
||
|
||
if neighbor_type == 'container':
|
||
debug_print(f"🎉 找到邻接的容器: {neighbor} 🥽✨")
|
||
return neighbor
|
||
|
||
debug_print("😞 未找到连接的容器 💔")
|
||
return None
|
||
|
||
def generate_evaporate_protocol(
|
||
G: nx.DiGraph,
|
||
vessel: dict, # 🔧 修改:从字符串改为字典类型
|
||
pressure: float = 0.1,
|
||
temp: float = 60.0,
|
||
time: Union[str, float] = "180", # 🔧 修改:支持字符串时间
|
||
stir_speed: float = 100.0,
|
||
solvent: str = "",
|
||
**kwargs
|
||
) -> List[Dict[str, Any]]:
|
||
"""
|
||
生成蒸发操作的协议序列 - 支持单位和体积运算
|
||
|
||
Args:
|
||
G: 设备图
|
||
vessel: 容器字典(从XDL传入)
|
||
pressure: 真空度 (bar),默认0.1
|
||
temp: 加热温度 (°C),默认60
|
||
time: 蒸发时间(支持 "3 min", "180", "0.5 h" 等)
|
||
stir_speed: 旋转速度 (RPM),默认100
|
||
solvent: 溶剂名称(用于参数优化)
|
||
**kwargs: 其他参数(兼容性)
|
||
|
||
Returns:
|
||
List[Dict[str, Any]]: 动作序列
|
||
"""
|
||
|
||
# 🔧 核心修改:从字典中提取容器ID
|
||
# 统一处理vessel参数
|
||
if isinstance(vessel, dict):
|
||
if "id" not in vessel:
|
||
vessel_id = list(vessel.values())[0].get("id", "")
|
||
else:
|
||
vessel_id = vessel.get("id", "")
|
||
vessel_data = vessel.get("data", {})
|
||
else:
|
||
vessel_id = str(vessel)
|
||
vessel_data = G.nodes[vessel_id].get("data", {}) if vessel_id in G.nodes() else {}
|
||
|
||
debug_print("🌟" * 20)
|
||
debug_print("🌪️ 开始生成蒸发协议(支持单位和体积运算)✨")
|
||
debug_print(f"📝 输入参数:")
|
||
debug_print(f" 🥽 vessel: {vessel} (ID: {vessel_id})")
|
||
debug_print(f" 💨 pressure: {pressure} bar")
|
||
debug_print(f" 🌡️ temp: {temp}°C")
|
||
debug_print(f" ⏰ time: {time} (类型: {type(time)})")
|
||
debug_print(f" 🌪️ stir_speed: {stir_speed} RPM")
|
||
debug_print(f" 🧪 solvent: '{solvent}'")
|
||
debug_print("🌟" * 20)
|
||
|
||
# 🔧 新增:记录蒸发前的容器状态
|
||
debug_print("🔍 记录蒸发前容器状态...")
|
||
original_liquid_volume = 0.0
|
||
if "data" in vessel and "liquid_volume" in vessel["data"]:
|
||
current_volume = vessel["data"]["liquid_volume"]
|
||
if isinstance(current_volume, list) and len(current_volume) > 0:
|
||
original_liquid_volume = current_volume[0]
|
||
elif isinstance(current_volume, (int, float)):
|
||
original_liquid_volume = current_volume
|
||
debug_print(f"📊 蒸发前液体体积: {original_liquid_volume:.2f}mL")
|
||
|
||
# === 步骤1: 查找旋转蒸发仪设备 ===
|
||
debug_print("📍 步骤1: 查找旋转蒸发仪设备... 🔍")
|
||
|
||
# 验证vessel参数
|
||
if not vessel_id:
|
||
debug_print("❌ vessel 参数不能为空! 😱")
|
||
raise ValueError("vessel 参数不能为空")
|
||
|
||
# 查找旋转蒸发仪设备
|
||
rotavap_device = find_rotavap_device(G, vessel_id)
|
||
if not rotavap_device:
|
||
debug_print("💥 未找到旋转蒸发仪设备! 😭")
|
||
raise ValueError(f"未找到旋转蒸发仪设备。请检查组态图中是否包含 class 包含 'rotavap'、'rotary' 或 'evaporat' 的设备")
|
||
|
||
debug_print(f"🎉 成功找到旋转蒸发仪: {rotavap_device} ✨")
|
||
|
||
# === 步骤2: 确定目标容器 ===
|
||
debug_print("📍 步骤2: 确定目标容器... 🥽")
|
||
|
||
target_vessel = vessel_id
|
||
|
||
# 如果vessel就是旋转蒸发仪设备,查找连接的容器
|
||
if vessel_id == rotavap_device:
|
||
debug_print("🔄 vessel就是旋转蒸发仪,查找连接的容器...")
|
||
connected_vessel = find_connected_vessel(G, rotavap_device)
|
||
if connected_vessel:
|
||
target_vessel = connected_vessel
|
||
debug_print(f"✅ 使用连接的容器: {target_vessel} 🥽✨")
|
||
else:
|
||
debug_print(f"⚠️ 未找到连接的容器,使用设备本身: {rotavap_device} 🔧")
|
||
target_vessel = rotavap_device
|
||
elif vessel_id in G.nodes() and G.nodes[vessel_id].get('type') == 'container':
|
||
debug_print(f"✅ 使用指定的容器: {vessel_id} 🥽✨")
|
||
target_vessel = vessel_id
|
||
else:
|
||
debug_print(f"⚠️ 容器 '{vessel_id}' 不存在或类型不正确,使用旋转蒸发仪设备: {rotavap_device} 🔧")
|
||
target_vessel = rotavap_device
|
||
|
||
# === 🔧 新增:步骤3:单位解析处理 ===
|
||
debug_print("📍 步骤3: 单位解析处理... ⚡")
|
||
|
||
# 解析时间
|
||
final_time = parse_time_input(time)
|
||
debug_print(f"🎯 时间解析完成: {time} → {final_time}s ({final_time/60:.1f}分钟) ⏰✨")
|
||
|
||
# === 步骤4: 参数验证和修正 ===
|
||
debug_print("📍 步骤4: 参数验证和修正... 🔧")
|
||
|
||
# 修正参数范围
|
||
if pressure <= 0 or pressure > 1.0:
|
||
debug_print(f"⚠️ 真空度 {pressure} bar 超出范围,修正为 0.1 bar 💨")
|
||
pressure = 0.1
|
||
else:
|
||
debug_print(f"✅ 真空度 {pressure} bar 在正常范围内 💨")
|
||
|
||
if temp < 10.0 or temp > 200.0:
|
||
debug_print(f"⚠️ 温度 {temp}°C 超出范围,修正为 60°C 🌡️")
|
||
temp = 60.0
|
||
else:
|
||
debug_print(f"✅ 温度 {temp}°C 在正常范围内 🌡️")
|
||
|
||
if final_time <= 0:
|
||
debug_print(f"⚠️ 时间 {final_time}s 无效,修正为 180s (3分钟) ⏰")
|
||
final_time = 180.0
|
||
else:
|
||
debug_print(f"✅ 时间 {final_time}s ({final_time/60:.1f}分钟) 有效 ⏰")
|
||
|
||
if stir_speed < 10.0 or stir_speed > 300.0:
|
||
debug_print(f"⚠️ 旋转速度 {stir_speed} RPM 超出范围,修正为 100 RPM 🌪️")
|
||
stir_speed = 100.0
|
||
else:
|
||
debug_print(f"✅ 旋转速度 {stir_speed} RPM 在正常范围内 🌪️")
|
||
|
||
# 根据溶剂优化参数
|
||
if solvent:
|
||
debug_print(f"🧪 根据溶剂 '{solvent}' 优化参数... 🔬")
|
||
solvent_lower = solvent.lower()
|
||
|
||
if any(s in solvent_lower for s in ['water', 'aqueous', 'h2o']):
|
||
temp = max(temp, 80.0)
|
||
pressure = max(pressure, 0.2)
|
||
debug_print("💧 水系溶剂:提高温度和真空度 🌡️💨")
|
||
elif any(s in solvent_lower for s in ['ethanol', 'methanol', 'acetone']):
|
||
temp = min(temp, 50.0)
|
||
pressure = min(pressure, 0.05)
|
||
debug_print("🍺 易挥发溶剂:降低温度和真空度 🌡️💨")
|
||
elif any(s in solvent_lower for s in ['dmso', 'dmi', 'toluene']):
|
||
temp = max(temp, 100.0)
|
||
pressure = min(pressure, 0.01)
|
||
debug_print("🔥 高沸点溶剂:提高温度,降低真空度 🌡️💨")
|
||
else:
|
||
debug_print("🧪 通用溶剂,使用标准参数 ✨")
|
||
else:
|
||
debug_print("🤷♀️ 未指定溶剂,使用默认参数 ✨")
|
||
|
||
debug_print(f"🎯 最终参数: pressure={pressure} bar 💨, temp={temp}°C 🌡️, time={final_time}s ⏰, stir_speed={stir_speed} RPM 🌪️")
|
||
|
||
# === 🔧 新增:步骤5:蒸发体积计算 ===
|
||
debug_print("📍 步骤5: 蒸发体积计算... 📊")
|
||
|
||
# 根据温度、真空度、时间和溶剂类型估算蒸发量
|
||
evaporation_volume = 0.0
|
||
if original_liquid_volume > 0:
|
||
# 基础蒸发速率(mL/min)
|
||
base_evap_rate = 0.5 # 基础速率
|
||
|
||
# 温度系数(高温蒸发更快)
|
||
temp_factor = 1.0 + (temp - 25.0) / 100.0
|
||
|
||
# 真空系数(真空度越高蒸发越快)
|
||
vacuum_factor = 1.0 + (1.0 - pressure) * 2.0
|
||
|
||
# 溶剂系数
|
||
solvent_factor = 1.0
|
||
if solvent:
|
||
solvent_lower = solvent.lower()
|
||
if any(s in solvent_lower for s in ['water', 'h2o']):
|
||
solvent_factor = 0.8 # 水蒸发较慢
|
||
elif any(s in solvent_lower for s in ['ethanol', 'methanol', 'acetone']):
|
||
solvent_factor = 1.5 # 易挥发溶剂蒸发快
|
||
elif any(s in solvent_lower for s in ['dmso', 'dmi']):
|
||
solvent_factor = 0.3 # 高沸点溶剂蒸发慢
|
||
|
||
# 计算总蒸发量
|
||
total_evap_rate = base_evap_rate * temp_factor * vacuum_factor * solvent_factor
|
||
evaporation_volume = min(
|
||
original_liquid_volume * 0.95, # 最多蒸发95%
|
||
total_evap_rate * (final_time / 60.0) # 时间相关的蒸发量
|
||
)
|
||
|
||
debug_print(f"📊 蒸发量计算:")
|
||
debug_print(f" - 基础蒸发速率: {base_evap_rate} mL/min")
|
||
debug_print(f" - 温度系数: {temp_factor:.2f} (基于 {temp}°C)")
|
||
debug_print(f" - 真空系数: {vacuum_factor:.2f} (基于 {pressure} bar)")
|
||
debug_print(f" - 溶剂系数: {solvent_factor:.2f} ({solvent or '通用'})")
|
||
debug_print(f" - 总蒸发速率: {total_evap_rate:.2f} mL/min")
|
||
debug_print(f" - 预计蒸发量: {evaporation_volume:.2f}mL ({evaporation_volume/original_liquid_volume*100:.1f}%)")
|
||
|
||
# === 步骤6: 生成动作序列 ===
|
||
debug_print("📍 步骤6: 生成动作序列... 🎬")
|
||
|
||
action_sequence = []
|
||
|
||
# 1. 等待稳定
|
||
debug_print(" 🔄 动作1: 添加初始等待稳定... ⏳")
|
||
action_sequence.append({
|
||
"action_name": "wait",
|
||
"action_kwargs": {"time": 10}
|
||
})
|
||
debug_print(" ✅ 初始等待动作已添加 ⏳✨")
|
||
|
||
# 2. 执行蒸发
|
||
debug_print(f" 🌪️ 动作2: 执行蒸发操作...")
|
||
debug_print(f" 🔧 设备: {rotavap_device}")
|
||
debug_print(f" 🥽 容器: {target_vessel}")
|
||
debug_print(f" 💨 真空度: {pressure} bar")
|
||
debug_print(f" 🌡️ 温度: {temp}°C")
|
||
debug_print(f" ⏰ 时间: {final_time}s ({final_time/60:.1f}分钟)")
|
||
debug_print(f" 🌪️ 旋转速度: {stir_speed} RPM")
|
||
|
||
evaporate_action = {
|
||
"device_id": rotavap_device,
|
||
"action_name": "evaporate",
|
||
"action_kwargs": {
|
||
"vessel": target_vessel,
|
||
"pressure": float(pressure),
|
||
"temp": float(temp),
|
||
"time": float(final_time), # 🔧 强制转换为float类型
|
||
"stir_speed": float(stir_speed),
|
||
"solvent": str(solvent)
|
||
}
|
||
}
|
||
action_sequence.append(evaporate_action)
|
||
debug_print(" ✅ 蒸发动作已添加 🌪️✨")
|
||
|
||
# 🔧 新增:蒸发过程中的体积变化
|
||
debug_print(" 🔧 更新容器体积 - 蒸发过程...")
|
||
if evaporation_volume > 0:
|
||
new_volume = max(0.0, original_liquid_volume - evaporation_volume)
|
||
|
||
# 更新vessel字典中的体积
|
||
if "data" in vessel and "liquid_volume" in vessel["data"]:
|
||
current_volume = vessel["data"]["liquid_volume"]
|
||
if isinstance(current_volume, list):
|
||
if len(current_volume) > 0:
|
||
vessel["data"]["liquid_volume"][0] = new_volume
|
||
else:
|
||
vessel["data"]["liquid_volume"] = [new_volume]
|
||
elif isinstance(current_volume, (int, float)):
|
||
vessel["data"]["liquid_volume"] = new_volume
|
||
else:
|
||
vessel["data"]["liquid_volume"] = new_volume
|
||
|
||
# 🔧 同时更新图中的容器数据
|
||
if vessel_id in G.nodes():
|
||
if 'data' not in G.nodes[vessel_id]:
|
||
G.nodes[vessel_id]['data'] = {}
|
||
|
||
vessel_node_data = G.nodes[vessel_id]['data']
|
||
current_node_volume = vessel_node_data.get('liquid_volume', 0.0)
|
||
|
||
if isinstance(current_node_volume, list):
|
||
if len(current_node_volume) > 0:
|
||
G.nodes[vessel_id]['data']['liquid_volume'][0] = new_volume
|
||
else:
|
||
G.nodes[vessel_id]['data']['liquid_volume'] = [new_volume]
|
||
else:
|
||
G.nodes[vessel_id]['data']['liquid_volume'] = new_volume
|
||
|
||
debug_print(f" 📊 蒸发体积变化: {original_liquid_volume:.2f}mL → {new_volume:.2f}mL (-{evaporation_volume:.2f}mL)")
|
||
|
||
# 3. 蒸发后等待
|
||
debug_print(" 🔄 动作3: 添加蒸发后等待... ⏳")
|
||
action_sequence.append({
|
||
"action_name": "wait",
|
||
"action_kwargs": {"time": 10}
|
||
})
|
||
debug_print(" ✅ 蒸发后等待动作已添加 ⏳✨")
|
||
|
||
# 🔧 新增:蒸发完成后的状态报告
|
||
final_liquid_volume = 0.0
|
||
if "data" in vessel and "liquid_volume" in vessel["data"]:
|
||
current_volume = vessel["data"]["liquid_volume"]
|
||
if isinstance(current_volume, list) and len(current_volume) > 0:
|
||
final_liquid_volume = current_volume[0]
|
||
elif isinstance(current_volume, (int, float)):
|
||
final_liquid_volume = current_volume
|
||
|
||
# === 总结 ===
|
||
debug_print("🎊" * 20)
|
||
debug_print(f"🎉 蒸发协议生成完成! ✨")
|
||
debug_print(f"📊 总动作数: {len(action_sequence)} 个 📝")
|
||
debug_print(f"🌪️ 旋转蒸发仪: {rotavap_device} 🔧")
|
||
debug_print(f"🥽 目标容器: {target_vessel} 🧪")
|
||
debug_print(f"⚙️ 蒸发参数: {pressure} bar 💨, {temp}°C 🌡️, {final_time}s ⏰, {stir_speed} RPM 🌪️")
|
||
debug_print(f"⏱️ 预计总时间: {(final_time + 20)/60:.1f} 分钟 ⌛")
|
||
debug_print(f"📊 体积变化:")
|
||
debug_print(f" - 蒸发前: {original_liquid_volume:.2f}mL")
|
||
debug_print(f" - 蒸发后: {final_liquid_volume:.2f}mL")
|
||
debug_print(f" - 蒸发量: {evaporation_volume:.2f}mL ({evaporation_volume/max(original_liquid_volume, 0.01)*100:.1f}%)")
|
||
debug_print("🎊" * 20)
|
||
|
||
return action_sequence
|