修复了部分的protocol因为XDL更新导致的问题 (#61)

* 修复了部分的protocol因为XDL更新导致的问题

但是pumptransfer，add，dissolve，separate还没修，后续还需要写virtual固体加料器

* 补充了四个action

* 添加了固体加样器，丰富了json，修改了add protocol

* bump version to 0.9.9

* fix bugs from new actions

* protocol完整修复版本& bump version to 0.9.10

* 修补了一些单位处理，bump version to 0.9.11

* 优化了全protocol的运行时间，除了pumptransfer相关的还没

* 补充了剩下的几个protocol

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Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@dp.tech>
Co-authored-by: Xuwznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com>

unilabos/compile/utils/unit_parser.py

@@ -0,0 +1,206 @@
+"""
+统一的单位解析工具模块
+支持时间、体积、质量等各种单位的解析
+"""
+
+import re
+import logging
+from typing import Union
+
+logger = logging.getLogger(__name__)
+
+def debug_print(message, prefix="[UNIT_PARSER]"):
+    """调试输出"""
+    print(f"{prefix} {message}", flush=True)
+    logger.info(f"{prefix} {message}")
+
+def parse_time_with_units(time_input: Union[str, float, int], default_unit: str = "s") -> float:
+    """
+    解析带单位的时间输入
+    
+    Args:
+        time_input: 时间输入（如 "30 min", "1 h", "300", "?", 60.0）
+        default_unit: 默认单位（默认为秒）
+    
+    Returns:
+        float: 时间（秒）
+    """
+    if not time_input:
+        return 0.0
+    
+    # 处理数值输入
+    if isinstance(time_input, (int, float)):
+        result = float(time_input)
+        debug_print(f"数值时间输入: {time_input} → {result}s（默认单位）")
+        return result
+    
+    # 处理字符串输入
+    time_str = str(time_input).lower().strip()
+    debug_print(f"解析时间字符串: '{time_str}'")
+    
+    # 处理特殊值
+    if time_str in ['?', 'unknown', 'tbd', 'to be determined']:
+        default_time = 300.0  # 5分钟默认值
+        debug_print(f"检测到未知时间，使用默认值: {default_time}s")
+        return default_time
+    
+    # 如果是纯数字，使用默认单位
+    try:
+        value = float(time_str)
+        if default_unit == "s":
+            result = value
+        elif default_unit in ["min", "minute"]:
+            result = value * 60.0
+        elif default_unit in ["h", "hour"]:
+            result = value * 3600.0
+        else:
+            result = value  # 默认秒
+        debug_print(f"纯数字输入: {time_str} → {result}s（单位: {default_unit}）")
+        return result
+    except ValueError:
+        pass
+    
+    # 使用正则表达式匹配数字和单位
+    pattern = r'(\d+\.?\d*)\s*([a-z]*)'
+    match = re.match(pattern, time_str)
+    
+    if not match:
+        debug_print(f"⚠️ 无法解析时间: '{time_str}'，使用默认值: 60s")
+        return 60.0
+    
+    value = float(match.group(1))
+    unit = match.group(2) or default_unit
+    
+    # 单位转换映射
+    unit_multipliers = {
+        # 秒
+        's': 1.0,
+        'sec': 1.0,
+        'second': 1.0,
+        'seconds': 1.0,
+        
+        # 分钟
+        'm': 60.0,
+        'min': 60.0,
+        'mins': 60.0,
+        'minute': 60.0,
+        'minutes': 60.0,
+        
+        # 小时
+        'h': 3600.0,
+        'hr': 3600.0,
+        'hrs': 3600.0,
+        'hour': 3600.0,
+        'hours': 3600.0,
+        
+        # 天
+        'd': 86400.0,
+        'day': 86400.0,
+        'days': 86400.0,
+    }
+    
+    multiplier = unit_multipliers.get(unit, 1.0)
+    result = value * multiplier
+    
+    debug_print(f"时间解析: '{time_str}' → {value} {unit} → {result}s")
+    return result
+
+def parse_volume_with_units(volume_input: Union[str, float, int], default_unit: str = "mL") -> float:
+    """
+    解析带单位的体积输入
+    
+    Args:
+        volume_input: 体积输入（如 "100 mL", "2.5 L", "500", "?", 100.0）
+        default_unit: 默认单位（默认为毫升）
+    
+    Returns:
+        float: 体积（毫升）
+    """
+    if not volume_input:
+        return 0.0
+    
+    # 处理数值输入
+    if isinstance(volume_input, (int, float)):
+        result = float(volume_input)
+        debug_print(f"数值体积输入: {volume_input} → {result}mL（默认单位）")
+        return result
+    
+    # 处理字符串输入
+    volume_str = str(volume_input).lower().strip()
+    debug_print(f"解析体积字符串: '{volume_str}'")
+    
+    # 处理特殊值
+    if volume_str in ['?', 'unknown', 'tbd', 'to be determined']:
+        default_volume = 50.0  # 50mL默认值
+        debug_print(f"检测到未知体积，使用默认值: {default_volume}mL")
+        return default_volume
+    
+    # 如果是纯数字，使用默认单位
+    try:
+        value = float(volume_str)
+        if default_unit.lower() in ["ml", "milliliter"]:
+            result = value
+        elif default_unit.lower() in ["l", "liter"]:
+            result = value * 1000.0
+        elif default_unit.lower() in ["μl", "ul", "microliter"]:
+            result = value / 1000.0
+        else:
+            result = value  # 默认mL
+        debug_print(f"纯数字输入: {volume_str} → {result}mL（单位: {default_unit}）")
+        return result
+    except ValueError:
+        pass
+    
+    # 移除空格并提取数字和单位
+    volume_clean = re.sub(r'\s+', '', volume_str)
+    
+    # 匹配数字和单位的正则表达式
+    match = re.match(r'([0-9]*\.?[0-9]+)\s*(ml|l|μl|ul|microliter|milliliter|liter)?', volume_clean)
+    
+    if not match:
+        debug_print(f"⚠️ 无法解析体积: '{volume_str}'，使用默认值: 50mL")
+        return 50.0
+    
+    value = float(match.group(1))
+    unit = match.group(2) or default_unit.lower()
+    
+    # 转换为毫升
+    if unit in ['l', 'liter']:
+        volume = value * 1000.0  # L -> mL
+    elif unit in ['μl', 'ul', 'microliter']:
+        volume = value / 1000.0  # μL -> mL
+    else:  # ml, milliliter 或默认
+        volume = value  # 已经是mL
+    
+    debug_print(f"体积解析: '{volume_str}' → {value} {unit} → {volume}mL")
+    return volume
+
+# 测试函数
+def test_unit_parser():
+    """测试单位解析功能"""
+    print("=== 单位解析器测试 ===")
+    
+    # 测试时间解析
+    time_tests = [
+        "30 min", "1 h", "300", "5.5 h", "?", 60.0, "2 hours", "30 s"
+    ]
+    
+    print("\n时间解析测试:")
+    for time_input in time_tests:
+        result = parse_time_with_units(time_input)
+        print(f"  {time_input} → {result}s ({result/60:.1f}min)")
+    
+    # 测试体积解析
+    volume_tests = [
+        "100 mL", "2.5 L", "500", "?", 100.0, "500 μL", "1 liter"
+    ]
+    
+    print("\n体积解析测试:")
+    for volume_input in volume_tests:
+        result = parse_volume_with_units(volume_input)
+        print(f"  {volume_input} → {result}mL")
+    
+    print("\n✅ 测试完成")
+
+if __name__ == "__main__":
+    test_unit_parser()