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This commit is contained in:
Junhan Chang
966
test/experiments/Grignard_flow_batchreact_single_pumpvalve.json
Normal file
966
test/experiments/Grignard_flow_batchreact_single_pumpvalve.json
Normal file
@@ -0,0 +1,966 @@
|
||||
{
|
||||
"nodes": [
|
||||
{
|
||||
"id": "YugongStation",
|
||||
"name": "愚公常量合成工作站",
|
||||
"children": [
|
||||
"serial_pump",
|
||||
"pump_reagents",
|
||||
"flask_CH2Cl2",
|
||||
"flask_acetone",
|
||||
"flask_NH4Cl",
|
||||
"flask_grignard",
|
||||
"flask_THF",
|
||||
"reactor",
|
||||
"pump_workup",
|
||||
"waste_workup",
|
||||
"separator_controller",
|
||||
"flask_separator",
|
||||
"flask_holding",
|
||||
"flask_H2O",
|
||||
"flask_NaHCO3",
|
||||
"pump_column",
|
||||
"rotavap",
|
||||
"flask_rv",
|
||||
"column",
|
||||
"flask_column",
|
||||
"flask_air",
|
||||
"dry_column",
|
||||
"flask_dry_column",
|
||||
"pump_ext",
|
||||
"stirrer"
|
||||
],
|
||||
"parent": null,
|
||||
"type": "device",
|
||||
"class": "workstation",
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 620.6111111111111,
|
||||
"y": 171,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
"protocol_type": ["PumpTransferProtocol", "CleanProtocol", "SeparateProtocol", "EvaporateProtocol"]
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "serial_pump",
|
||||
"name": "serial_pump",
|
||||
"children": [],
|
||||
"parent": "YugongStation",
|
||||
"type": "device",
|
||||
"class": "serial",
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 620.6111111111111,
|
||||
"y": 171,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
"port": "COM7",
|
||||
"baudrate": 9600
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "pump_reagents",
|
||||
"name": "pump_reagents",
|
||||
"children": [],
|
||||
"parent": "YugongStation",
|
||||
"type": "device",
|
||||
"class": "syringepump.runze",
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 620.6111111111111,
|
||||
"y": 171,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
"port": "/devices/PumpBackbone/Serial/serialwrite",
|
||||
"address": "1",
|
||||
"max_volume": 25.0
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
"max_velocity": 1.0,
|
||||
"position": 0.0,
|
||||
"status": "Idle",
|
||||
"valve_position": "0"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "flask_CH2Cl2",
|
||||
"name": "flask_CH2Cl2",
|
||||
"children": [],
|
||||
"parent": "YugongStation",
|
||||
"type": "container",
|
||||
"class": null,
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 430.4087301587302,
|
||||
"y": 428,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
"max_volume": 2000.0
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
"liquid": [
|
||||
{
|
||||
"liquid_type": "CH2Cl2",
|
||||
"liquid_volume": 1500.0
|
||||
}
|
||||
]
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "flask_acetone",
|
||||
"name": "flask_acetone",
|
||||
"children": [],
|
||||
"parent": "YugongStation",
|
||||
"type": "container",
|
||||
"class": null,
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 295.36944444444447,
|
||||
"y": 428,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
"max_volume": 2000.0
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
"liquid": [
|
||||
{
|
||||
"liquid_type": "acetone",
|
||||
"liquid_volume": 1500.0
|
||||
}
|
||||
]
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "flask_NH4Cl",
|
||||
"name": "flask_NH4Cl",
|
||||
"children": [],
|
||||
"parent": "YugongStation",
|
||||
"type": "container",
|
||||
"class": null,
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 165.36944444444444,
|
||||
"y": 428,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
"max_volume": 2000.0
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
"liquid": [
|
||||
{
|
||||
"liquid_type": "NH4Cl",
|
||||
"liquid_volume": 1500.0
|
||||
}
|
||||
]
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "flask_grignard",
|
||||
"name": "flask_grignard",
|
||||
"children": [],
|
||||
"parent": "YugongStation",
|
||||
"type": "container",
|
||||
"class": null,
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 165.36944444444444,
|
||||
"y": 428,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
"max_volume": 2000.0
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
"liquid": [
|
||||
{
|
||||
"liquid_type": "grignard",
|
||||
"liquid_volume": 1500.0
|
||||
}
|
||||
]
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "flask_THF",
|
||||
"name": "flask_THF",
|
||||
"children": [],
|
||||
"parent": "YugongStation",
|
||||
"type": "container",
|
||||
"class": null,
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 35,
|
||||
"y": 428,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
"max_volume": 2000.0
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
"liquid": [
|
||||
{
|
||||
"liquid_type": "THF",
|
||||
"liquid_volume": 1500.0
|
||||
}
|
||||
]
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "reactor",
|
||||
"name": "reactor",
|
||||
"children": [],
|
||||
"parent": "YugongStation",
|
||||
"type": "container",
|
||||
"class": null,
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 698.1111111111111,
|
||||
"y": 428,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
"max_volume": 5000.0
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
"liquid": [
|
||||
]
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "stirrer",
|
||||
"name": "stirrer",
|
||||
"children": [],
|
||||
"parent": "YugongStation",
|
||||
"type": "device",
|
||||
"class": "heaterstirrer.dalong",
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 698.1111111111111,
|
||||
"y": 478,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
"port": "COM43",
|
||||
"temp_warning": 60.0
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
"status": "Idle",
|
||||
"temp": 0.0,
|
||||
"stir_speed": 0.0
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "pump_workup",
|
||||
"name": "pump_workup",
|
||||
"children": [],
|
||||
"parent": "YugongStation",
|
||||
"type": "device",
|
||||
"class": "syringepump.runze",
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 1195.611507936508,
|
||||
"y": 686,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
"port": "/devices/PumpBackbone/Serial/serialwrite",
|
||||
"address": "2",
|
||||
"max_volume": 25.0
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
"max_velocity": 1.0,
|
||||
"position": 0.0,
|
||||
"status": "Idle",
|
||||
"valve_position": "0"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "waste_workup",
|
||||
"name": "waste_workup",
|
||||
"children": [],
|
||||
"parent": "YugongStation",
|
||||
"type": "container",
|
||||
"class": null,
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 1587.703373015873,
|
||||
"y": 1172.5,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
"max_volume": 2000.0
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
"liquid": [
|
||||
]
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "separator_controller",
|
||||
"name": "separator_controller",
|
||||
"children": [],
|
||||
"parent": "YugongStation",
|
||||
"type": "device",
|
||||
"class": "separator_controller",
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 1624.4027777777778,
|
||||
"y": 665.5,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
"port_executor": "COM41",
|
||||
"port_sensor": "COM40"
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
"sensordata": 0.0,
|
||||
"status": "Idle"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "flask_separator",
|
||||
"name": "flask_separator",
|
||||
"children": [],
|
||||
"parent": "YugongStation",
|
||||
"type": "container",
|
||||
"class": null,
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 1614.404365079365,
|
||||
"y": 948,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
"max_volume": 2000.0
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
"liquid": [
|
||||
]
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "flask_holding",
|
||||
"name": "flask_holding",
|
||||
"children": [],
|
||||
"parent": "YugongStation",
|
||||
"type": "container",
|
||||
"class": null,
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 1915.7035714285714,
|
||||
"y": 665.5,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
"max_volume": 2000.0
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
"liquid": [
|
||||
]
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "flask_H2O",
|
||||
"name": "flask_H2O",
|
||||
"children": [],
|
||||
"parent": "YugongStation",
|
||||
"type": "container",
|
||||
"class": null,
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 1785.7035714285714,
|
||||
"y": 665.5,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
"max_volume": 2000.0
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
"liquid": [
|
||||
{
|
||||
"liquid_type": "H2O",
|
||||
"liquid_volume": 1500.0
|
||||
}
|
||||
]
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "flask_NaHCO3",
|
||||
"name": "flask_NaHCO3",
|
||||
"children": [],
|
||||
"parent": "YugongStation",
|
||||
"type": "container",
|
||||
"class": null,
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 2054.0650793650793,
|
||||
"y": 665.5,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
"max_volume": 2000.0
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
"liquid": [
|
||||
{
|
||||
"liquid_type": "NaHCO3",
|
||||
"liquid_volume": 1500.0
|
||||
}
|
||||
]
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "pump_column",
|
||||
"name": "pump_column",
|
||||
"children": [],
|
||||
"parent": "YugongStation",
|
||||
"type": "device",
|
||||
"class": "syringepump.runze",
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 1630.6527777777778,
|
||||
"y": 448.5,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
"port": "/devices/PumpBackbone/Serial/serialwrite",
|
||||
"address": "3",
|
||||
"max_volume": 25.0
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
"max_velocity": 1.0,
|
||||
"position": 0.0,
|
||||
"status": "Idle",
|
||||
"valve_position": "0"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "rotavap",
|
||||
"name": "rotavap",
|
||||
"children": [],
|
||||
"parent": "YugongStation",
|
||||
"type": "device",
|
||||
"class": "rotavap",
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 1339.7031746031746,
|
||||
"y": 968.5,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
"port": "COM15"
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
"temperature": 0.0,
|
||||
"rotate_time": 0.0,
|
||||
"status": "Idle"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "flask_rv",
|
||||
"name": "flask_rv",
|
||||
"children": [],
|
||||
"parent": "YugongStation",
|
||||
"type": "container",
|
||||
"class": null,
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 1339.7031746031746,
|
||||
"y": 1152,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
"max_volume": 2000.0
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
"liquid": [
|
||||
]
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "column",
|
||||
"name": "column",
|
||||
"children": [],
|
||||
"parent": "YugongStation",
|
||||
"type": "container",
|
||||
"class": null,
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 909.722619047619,
|
||||
"y": 948,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
"max_volume": 200.0
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
"liquid": [
|
||||
]
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "flask_column",
|
||||
"name": "flask_column",
|
||||
"children": [],
|
||||
"parent": "YugongStation",
|
||||
"type": "container",
|
||||
"class": null,
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 867.972619047619,
|
||||
"y": 1152,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
"max_volume": 2000.0
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
"liquid": [
|
||||
]
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "flask_air",
|
||||
"name": "flask_air",
|
||||
"children": [],
|
||||
"parent": "YugongStation",
|
||||
"type": "container",
|
||||
"class": null,
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 742.722619047619,
|
||||
"y": 948,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
"max_volume": 2000.0
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
"liquid": [
|
||||
]
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "dry_column",
|
||||
"name": "dry_column",
|
||||
"children": [],
|
||||
"parent": "YugongStation",
|
||||
"type": "container",
|
||||
"class": null,
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 1206.722619047619,
|
||||
"y": 948,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
"max_volume": 200.0
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
"liquid": [
|
||||
]
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
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"id": "flask_dry_column",
|
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|
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|
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"parent": "YugongStation",
|
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"type": "container",
|
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|
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|
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|
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|
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|
||||
},
|
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"config": {
|
||||
"max_volume": 2000.0
|
||||
},
|
||||
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|
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"liquid": [
|
||||
]
|
||||
}
|
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|
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{
|
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"id": "pump_ext",
|
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|
||||
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|
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"parent": "YugongStation",
|
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"type": "device",
|
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"class": "syringepump.runze",
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 1469.7031746031746,
|
||||
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|
||||
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|
||||
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|
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|
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|
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|
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|
||||
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|
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|
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|
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|
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|
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|
||||
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|
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|
||||
{
|
||||
"id": "AGV",
|
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|
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"children": ["zhixing_agv", "zhixing_ur_arm"],
|
||||
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|
||||
"type": "device",
|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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"type": "device",
|
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|
||||
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|
||||
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|
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|
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|
||||
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|
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|
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|
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|
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|
||||
}
|
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|
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{
|
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|
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|
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"children": [],
|
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|
||||
"type": "device",
|
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|
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"position": {
|
||||
"x": 698.1111111111111,
|
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|
||||
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|
||||
},
|
||||
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|
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|
||||
},
|
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|
||||
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|
||||
}
|
||||
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|
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|
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{
|
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|
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|
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"type": "communication",
|
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|
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|
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|
||||
}
|
||||
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|
||||
{
|
||||
"source": "pump_workup",
|
||||
"target": "serial_pump",
|
||||
"type": "communication",
|
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|
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|
||||
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|
||||
}
|
||||
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|
||||
{
|
||||
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|
||||
"target": "serial_pump",
|
||||
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|
||||
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|
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"pump_reagents": "port",
|
||||
"serial_pump": "port"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "pump_ext",
|
||||
"target": "serial_pump",
|
||||
"type": "communication",
|
||||
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|
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"pump_reagents": "port",
|
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"serial_pump": "port"
|
||||
}
|
||||
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|
||||
{
|
||||
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|
||||
"target": "pump_reagents",
|
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|
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|
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|
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|
||||
}
|
||||
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|
||||
{
|
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|
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|
||||
"type": "physical",
|
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|
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|
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|
||||
}
|
||||
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|
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{
|
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"source": "separator_controller",
|
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|
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|
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|
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|
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|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
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"source": "column",
|
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"target": "flask_column",
|
||||
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|
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|
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|
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|
||||
}
|
||||
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|
||||
{
|
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"source": "dry_column",
|
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"target": "flask_dry_column",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"dry_column": "bottom",
|
||||
"flask_dry_column": "top"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "pump_ext",
|
||||
"target": "pump_column",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
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|
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|
||||
"pump_column": "1"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "pump_ext",
|
||||
"target": "waste_workup",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
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"pump_ext": "2",
|
||||
"waste_workup": "-1"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "pump_reagents",
|
||||
"target": "flask_THF",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"pump_reagents": "7",
|
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"flask_THF": "top"
|
||||
}
|
||||
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|
||||
{
|
||||
"source": "pump_reagents",
|
||||
"target": "flask_NH4Cl",
|
||||
"type": "physical",
|
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|
||||
"pump_reagents": "4",
|
||||
"flask_NH4Cl": "top"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "pump_reagents",
|
||||
"target": "flask_CH2Cl2",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"pump_reagents": "2",
|
||||
"flask_CH2Cl2": "top"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "pump_reagents",
|
||||
"target": "flask_acetone",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"pump_reagents": "3",
|
||||
"flask_acetone": "top"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "pump_reagents",
|
||||
"target": "pump_workup",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"pump_reagents": "1",
|
||||
"pump_workup": "8"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "pump_reagents",
|
||||
"target": "flask_grignard",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"pump_reagents": "6",
|
||||
"flask_grignard": "top"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "pump_reagents",
|
||||
"target": "reactor",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"pump_reagents": "5",
|
||||
"reactor": "top"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "pump_reagents",
|
||||
"target": "flask_air",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"pump_reagents": "8",
|
||||
"flask_air": "-1"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "pump_workup",
|
||||
"target": "waste_workup",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"pump_workup": "2",
|
||||
"waste_workup": "-1"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "pump_workup",
|
||||
"target": "flask_H2O",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"pump_workup": "7",
|
||||
"flask_H2O": "top"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "pump_workup",
|
||||
"target": "flask_NaHCO3",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"pump_workup": "6",
|
||||
"flask_NaHCO3": "top"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "pump_workup",
|
||||
"target": "pump_reagents",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"pump_workup": "8",
|
||||
"pump_reagents": "1"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "pump_workup",
|
||||
"target": "flask_holding",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"pump_workup": "5",
|
||||
"flask_holding": "top"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "pump_workup",
|
||||
"target": "separator_controller",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"pump_workup": "4",
|
||||
"separator_controller": "top"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "pump_workup",
|
||||
"target": "flask_separator",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"pump_workup": "3",
|
||||
"flask_separator": "top"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "pump_workup",
|
||||
"target": "pump_column",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"pump_workup": "1",
|
||||
"pump_column": "8"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "pump_column",
|
||||
"target": "column",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"pump_column": "4",
|
||||
"column": "top"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "pump_column",
|
||||
"target": "flask_column",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"pump_column": "3",
|
||||
"flask_column": "top"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "pump_column",
|
||||
"target": "rotavap",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"pump_column": "2",
|
||||
"rotavap": "-1"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "pump_column",
|
||||
"target": "pump_workup",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"pump_column": "8",
|
||||
"pump_workup": "1"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "pump_column",
|
||||
"target": "flask_air",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"pump_column": "5",
|
||||
"flask_air": "-1"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "pump_column",
|
||||
"target": "dry_column",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"pump_column": "7",
|
||||
"dry_column": "top"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "pump_column",
|
||||
"target": "flask_dry_column",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"pump_column": "6",
|
||||
"flask_dry_column": "top"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "pump_column",
|
||||
"target": "pump_ext",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"pump_column": "1",
|
||||
"pump_ext": "8"
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
]
|
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}
|
||||
174
test/experiments/HPLC.json
Normal file
174
test/experiments/HPLC.json
Normal file
@@ -0,0 +1,174 @@
|
||||
{
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|
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{
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|
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"x": 620.6111111111111,
|
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|
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|
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|
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|
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|
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"BottlesRack3"
|
||||
]
|
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|
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{
|
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|
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|
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|
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|
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"class": null,
|
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|
||||
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|
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|
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"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {},
|
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"data": {},
|
||||
"children": [
|
||||
"Bottle3-1",
|
||||
"Bottle3-2",
|
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"Bottle3-3",
|
||||
"Bottle3-4",
|
||||
"Bottle3-5",
|
||||
"Bottle3-6",
|
||||
"Bottle3-7",
|
||||
"Bottle3-8"
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "Bottle3-1",
|
||||
"name": "Bottle3-1",
|
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|
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|
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"class": null,
|
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"position": {
|
||||
"x": 620.6111111111111,
|
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|
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"z": 0
|
||||
},
|
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|
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|
||||
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|
||||
]
|
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},
|
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{
|
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|
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"name": "Bottle3-2",
|
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|
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|
||||
"class": null,
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 620.6111111111111,
|
||||
"y": 171,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {},
|
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|
||||
"children": [
|
||||
]
|
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},
|
||||
{
|
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|
||||
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|
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"parent": "BottlesRack3",
|
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|
||||
"class": null,
|
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"position": {
|
||||
"x": 620.6111111111111,
|
||||
"y": 171,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
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|
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|
||||
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|
||||
]
|
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},
|
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{
|
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|
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|
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|
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|
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"class": null,
|
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"position": {
|
||||
"x": 620.6111111111111,
|
||||
"y": 171,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {},
|
||||
"data": {},
|
||||
"children": [
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "Bottle3-5",
|
||||
"name": "Bottle3-5",
|
||||
"parent": "BottlesRack3",
|
||||
"type": "container",
|
||||
"class": null,
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 620.6111111111111,
|
||||
"y": 171,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {},
|
||||
"data": {},
|
||||
"children": [
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "Bottle3-6",
|
||||
"name": "Bottle3-6",
|
||||
"parent": "BottlesRack3",
|
||||
"type": "container",
|
||||
"class": null,
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 620.6111111111111,
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|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {},
|
||||
"data": {},
|
||||
"children": [
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "Bottle3-7",
|
||||
"name": "Bottle3-7",
|
||||
"parent": "BottlesRack3",
|
||||
"type": "container",
|
||||
"class": null,
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 620.6111111111111,
|
||||
"y": 171,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {},
|
||||
"data": {},
|
||||
"children": [
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "Bottle3-8",
|
||||
"name": "Bottle3-8",
|
||||
"parent": "BottlesRack3",
|
||||
"type": "container",
|
||||
"class": null,
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 620.6111111111111,
|
||||
"y": 171,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {},
|
||||
"data": {},
|
||||
"children": [
|
||||
]
|
||||
}
|
||||
],
|
||||
"links": []
|
||||
}
|
||||
4806
test/experiments/HT_hiwo.json
Normal file
4806
test/experiments/HT_hiwo.json
Normal file
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
21
test/experiments/deis_control_config.yaml
Normal file
21
test/experiments/deis_control_config.yaml
Normal file
@@ -0,0 +1,21 @@
|
||||
controller_manager:
|
||||
ros__parameters:
|
||||
update_rate: 1.0 # 更新频率，单位 Hz. 20s 更新一次
|
||||
|
||||
# 控制器列表
|
||||
controllers:
|
||||
deis_current_controller:
|
||||
type: EISModelBasedController # PID 控制器类型
|
||||
inputs:
|
||||
eis: # 环境输入（电化学阻抗谱）
|
||||
topic: /devices/BioLogic/EISdata # 输入话题
|
||||
type: list[float] # 输入数据类型
|
||||
outputs:
|
||||
current_control: # 控制输出（充电电流）
|
||||
topic: /devices/BioLogic/current_control # 输出话题
|
||||
type: float # 输出数据类型
|
||||
parameters:
|
||||
# set_point: 22.0 # 目标温度（可以动态更新）
|
||||
# kp: 1.0 # PID 参数
|
||||
# ki: 0.1
|
||||
# kd: 0.05
|
||||
54
test/experiments/devices.json
Normal file
54
test/experiments/devices.json
Normal file
@@ -0,0 +1,54 @@
|
||||
{
|
||||
"PumpBackbone": {
|
||||
"class": "protocol",
|
||||
"protocol_type": ["PumpTransferProtocol", "CleanProtocol", "SeparateProtocol", "EvaporateProtocol"],
|
||||
"children": {
|
||||
"Serial": {
|
||||
"class": "serial",
|
||||
"port": "COM7",
|
||||
"baudrate": 9600
|
||||
},
|
||||
"pump_reagents": {
|
||||
"class": "syringepump.runze",
|
||||
"port": "/devices/PumpBackbone/Serial/serialwrite",
|
||||
"address": "1"
|
||||
},
|
||||
"pump_workup": {
|
||||
"class": "syringepump.runze",
|
||||
"port": "/devices/PumpBackbone/Serial/serialwrite",
|
||||
"address": "2"
|
||||
},
|
||||
"pump_column": {
|
||||
"class": "syringepump.runze",
|
||||
"port": "/devices/PumpBackbone/Serial/serialwrite",
|
||||
"address": "3"
|
||||
},
|
||||
"pump_ext": {
|
||||
"class": "syringepump.runze",
|
||||
"port": "/devices/PumpBackbone/Serial/serialwrite",
|
||||
"address": "4"
|
||||
},
|
||||
"separator_controller": {
|
||||
"class": "separator_controller",
|
||||
"port_executor": "COM41",
|
||||
"port_sensor": "COM40"
|
||||
},
|
||||
"rotavap_chiller": {
|
||||
"class": "chiller",
|
||||
"port": "COM17"
|
||||
},
|
||||
"rotavap_controller": {
|
||||
"class": "rotavap",
|
||||
"port": "COM15"
|
||||
}
|
||||
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
"AichemecoHiWo": {
|
||||
"class": "work_station.aichemeco_hiwo"
|
||||
},
|
||||
"Stirrer": {
|
||||
"class": "heaterstirrer.dalong",
|
||||
"port": "COM43"
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
1
test/experiments/empty_devices.json
Normal file
1
test/experiments/empty_devices.json
Normal file
@@ -0,0 +1 @@
|
||||
{}
|
||||
1233
test/experiments/lidocaine-graph.json
Normal file
1233
test/experiments/lidocaine-graph.json
Normal file
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
158
test/experiments/mock_reactor.json
Normal file
158
test/experiments/mock_reactor.json
Normal file
@@ -0,0 +1,158 @@
|
||||
{
|
||||
"nodes": [
|
||||
{
|
||||
"id": "ReactorX",
|
||||
"name": "模拟常量合成工作站",
|
||||
"children": [
|
||||
"reactor",
|
||||
"vacuum_valve",
|
||||
"gas_valve",
|
||||
"vacuum_pump",
|
||||
"gas_source"
|
||||
],
|
||||
"parent": null,
|
||||
"type": "device",
|
||||
"class": "workstation",
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 620.6111111111111,
|
||||
"y": 171,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
"protocol_type": ["EvacuateAndRefillProtocol"]
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "reactor",
|
||||
"name": "reactor",
|
||||
"children": [],
|
||||
"parent": "ReactorX",
|
||||
"type": "container",
|
||||
"class": null,
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 698.1111111111111,
|
||||
"y": 428,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
"max_volume": 5000.0
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
"liquid": [
|
||||
]
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "vacuum_valve",
|
||||
"name": "vacuum_valve",
|
||||
"children": [
|
||||
],
|
||||
"parent": "ReactorX",
|
||||
"type": "device",
|
||||
"class": "solenoid_valve.mock",
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 620.6111111111111,
|
||||
"y": 171,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "gas_valve",
|
||||
"name": "gas_valve",
|
||||
"children": [
|
||||
],
|
||||
"parent": "ReactorX",
|
||||
"type": "device",
|
||||
"class": "solenoid_valve.mock",
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 620.6111111111111,
|
||||
"y": 171,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "vacuum_pump",
|
||||
"name": "vacuum_pump",
|
||||
"children": [
|
||||
],
|
||||
"parent": "ReactorX",
|
||||
"type": "device",
|
||||
"class": "vacuum_pump.mock",
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 620.6111111111111,
|
||||
"y": 171,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "gas_source",
|
||||
"name": "gas_source",
|
||||
"children": [
|
||||
],
|
||||
"parent": "ReactorX",
|
||||
"type": "device",
|
||||
"class": "gas_source.mock",
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 620.6111111111111,
|
||||
"y": 171,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
],
|
||||
"links": [
|
||||
{
|
||||
"source": "reactor",
|
||||
"target": "vacuum_valve",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"reactor": "top",
|
||||
"vacuum_valve": "1"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "reactor",
|
||||
"target": "gas_valve",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"reactor": "top",
|
||||
"gas_valve": "1"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "vacuum_pump",
|
||||
"target": "vacuum_valve",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"vacuum_pump": "out",
|
||||
"vacuum_valve": "0"
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"source": "gas_source",
|
||||
"target": "gas_valve",
|
||||
"type": "physical",
|
||||
"port": {
|
||||
"gas_source": "out",
|
||||
"gas_valve": "0"
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
]
|
||||
}
|
||||
10553
test/experiments/plr_test.json
Normal file
10553
test/experiments/plr_test.json
Normal file
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
43
test/experiments/test.json
Normal file
43
test/experiments/test.json
Normal file
@@ -0,0 +1,43 @@
|
||||
{
|
||||
"nodes": [
|
||||
{
|
||||
"id": "Gripper1",
|
||||
"name": "假夹爪",
|
||||
"children": [
|
||||
],
|
||||
"parent": null,
|
||||
"type": "device",
|
||||
"class": "gripper.mock",
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 620.6111111111111,
|
||||
"y": 171,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
}
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"id": "Plate1",
|
||||
"name": "Plate1",
|
||||
"children": [
|
||||
],
|
||||
"parent": null,
|
||||
"type": "plate",
|
||||
"class": "nest_96_wellplate_2ml_deep",
|
||||
"position": {
|
||||
"x": 620.6111111111111,
|
||||
"y": 171,
|
||||
"z": 0
|
||||
},
|
||||
"config": {
|
||||
},
|
||||
"data": {
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
],
|
||||
"links": [
|
||||
|
||||
]
|
||||
}
|
||||
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